卷十一，舉痛論篇第三十九，腹中論篇第四十，刺腰痛篇第四十一。
卷十二，風論篇第四十二，痺論篇第四十三，痿論篇第四十四，厥論篇第四十五。
卷十三，病能論篇第四十六，奇病論篇第四十七，大奇論篇第四十八，脈解篇第四十九。
卷十四，刺要論篇第五十，刺齊論篇第五十一，刺禁論篇第五十二，刺志論篇第五十三，針解篇第五十四，長刺節論篇第五十五。
卷十五，皮部論篇第五十六，經絡論篇第五十七，氣穴論篇第五十八，氣府論篇第五十九。
卷十六，骨空論篇第六十，水熱穴論篇第六十一。
卷十七，調經論篇第六十二。
卷十八，繆刺論篇第六十三，四時刺逆從論篇第六十四，標本病傳論篇第六十五。
卷十九，天元紀大論篇第六十六，五執行大論篇第六十七，六微旨大論篇第六十八。
卷二十，氣交變大論篇第六十九，五常政大論篇第七十。
卷二十一，六元正經大論篇第七十一，刺法論篇第七十二(遺篇，本病論篇第七十三(遺篇。
卷二十二，至真要大論篇第七十四。
卷二十三，著至教論篇第七十五，示從容論篇第七十六，疏五過論篇第七十七，徵四失論篇第七十八。
卷二十四，陰陽類論篇第七十九，方盛衰論篇第八十，解精微論篇第八十一。
摺疊靈樞目錄
卷一、九針十二原第一，本輸第二，小針解第三，邪氣藏府病形第四。
卷二、根結第五，壽夭剛柔第六，官針第七，本神第八，終始第九。
六腑，即膽、胃、大腸、小腸、膀胱和三焦。
奇恆之腑也屬於腑，但又異於常。係指腦、髓、骨、脈、膽和女子胞。這裡邊膽即是大腑之一，又屬於奇恆之腑。
臟腑雖因形態功能之不同而有所分，但它們之間卻不是孤立的，而是相互合作、相互為用的。
經絡系統可以分經脈、絡脈和腧穴三部分。經脈有正經十二:手太陰肺經、手陽明大腸經、足陽明胃經、足太陰脾經、手少陰心經、手太陽小腸經、足太陽膀胱經、足少陰腎經、手厥陰心包經、手少陽三焦經、足少陽膽經、足厥陰肝經。十二經脈首尾相聯如環無端，經氣流行其中週而復始。另有別於正經的奇經八脈:督脈、任脈、衝脈、帶脈、陰蹺脈、陽蹺脈、陰維脈、陽維脈。(注:“奇經八脈“一名始於《難經·二十七難》
經脈之間相交通聯絡的稱絡脈。其小者為孫絡不計其數;其大者有十五，稱十五絡脈。《靈樞·經脈》敘述的非常詳細。
腧穴為經氣遊行出入之所，有如運輸，是以名之。《黃帝內經》言腧穴者，首見《素問·氣穴論》，再見於《素問·氣府論》，兩論皆言三百六十五穴。實際《氣穴論》載穴三百四十二，《氣府論》載穴三百八十六。
精氣神為人身三寶。精，包括精、血、津、液;氣，指宗氣、榮氣、衛氣;神，指神、魂、魄、意、志。精和氣是構成人體的基本物質，氣和神又是人體的複雜的功能，也可以認為氣為精之御，精為神之宅，神為精氣之用。
摺疊病機學說
研究疾病發生、發展、轉歸及變化等等之內在機理的學說稱病機學說。
《素問·至真要大論》所說“審察病機，無失氣宜“、“謹守病機，各司其屬“都是此學說的內容。
1.病因:引起人發病的原因很多，《黃帝內經》將其歸納為二類。風雨寒暑實為“六淫“的概括;陰陽喜怒乃“七情“的概括;飲食居處即“飲食勞倦“。可以認為這就是後世三因說之濫觴。