不過這並不妨礙錢謙益的為官熱情，在這一次的京察之中，他不動聲色的配合了吏部，面對找上門來的門生弟子，也是好言安慰，為“僉都御史”進行辯護。也因此，最初的時候，京察進行的還算是順利。
一些老的御史被調出京師，到各省為僉都御史或者是御史，都察院補進了一批開明的新人，一些六部衙門的老官吏，也在這次京察中，被調離京師，一批從地方拔擢的新人，開始進入六部衙門，尤其是戶部工部等關鍵位置。
很快的，就有人察覺了朝廷此次京察的目的這分明是要將我輩，全部趕出京師啊？
他們不敢向皇帝發難，對袁繼咸和錢謙益也留有情面，於是紛紛將矛頭指向了吏部侍郎堵胤錫。
明代京察，總體上是比較模糊粗糙，有很多上下其手的空間，但具體程式卻又是嚴肅緊密，考察由吏部尚書、都察院左都御史御史共同主持，吏部侍郎、文選司、考功司郎中輔佐，這中間，除了吏部尚書和左都御史之外，就屬吏部侍郎的權力大了，因此，眾人矛頭自然是要指向堵胤錫。
一時，彈劾堵胤錫的奏疏，紛紛湧進內閣。
同時的，也有人在都察院門前張貼大字報，抨擊吏部侍郎以權謀私，抗議這次京察不公。
……
但不等堵胤錫上疏自辯，左都御史錢謙益就站出，對攻擊堵胤錫之言，大力駁斥，並舉出例子，說堵胤錫絕無徇私，連他同門師弟，同樣為馬世奇弟子的馬瑞，都調出京師了，何敢說他有私？
錢謙益一出，對堵胤錫的攻訐，立刻就減弱了不少，最後逐漸消失。
一來，錢謙益有身份，說話有份量；二來他說的是事實，連馬瑞都出京了，又有誰敢說堵胤錫謀私？
但同時的，對錢謙益的不滿，卻是大大增加，很多人覺得，牧齋先生背叛了他們。
可錢謙益卻是有苦說不出，對於堵胤錫被攻訐，錢謙益原本是想要袖手盤觀的，不想深夜之時，內監於海卻到家中，宣了陛下的口諭。錢謙益知道，自己想要置身事外是不可能了，如果堵胤錫出了事，陛下第一個要處置的就是他，沒辦法，他只能跳下場來，親自為堵胤錫辯解。
此次京察，規模超過以往，且又有都察院各省分院的安置，因此，原本三月底就應該結束的京察，一直到了五月初，白城子大勝的訊息傳來後，才漸漸地塵埃落定。
一些頑固，且沒有政績的老官僚，沒有什麼商議，全部清出京師，一些開明的地層官吏，進入京師。
頑固，但卻清廉為官，一身正氣的人，都打發到地方都察院，為僉都御史，令他們監督地方官場，這一來，既發揮了他們的長處，也減輕了朝廷執行新政時候的掣肘。
一切完畢，奏請隆武帝，隆武帝御筆披紅，如此，隆武三年的京察，算是圓滿的劃上了句號。
……
“培原，就此別過了。”
三天後，京師城外的驛道邊，兩個好友正在灑淚而別。
一人是吏科給事中馬嘉植，另一個是兵科給事中柳寅東。
馬嘉植字培原，崇禎七年甲戌科進士，這一次京察，被外放為浙江僉都御史，雖然升了官，而且還是去富饒的浙江，但馬嘉植臉上卻是一點喜色都沒有，馬嘉植姓馬，臉型瘦長，因為性情剛直，彈劾激烈，在朝中素有“馬面王”的稱號，這一次被外放浙江，他十分憂慮，一張馬臉就拉的更長了。
此時面對柳寅東和一干好友的送行，他什麼也沒有說，只是拱拱手，上車離開。
馬車載著他，幾個隨從家人跟在身後，一路往浙江而去。
此時誰也不會知道，馬嘉植正在醞釀一封驚天動地的大奏疏。不久之後，就會震動天下。