尼奧還是一名駭客，專門在暗網上探尋這個世界真相。一天暗網達人墨菲斯還有女神崔妮蒂找到尼奧，在一番經典對話後，尼奧才知道Matrix是一個虛擬的作業系統。
其實，Matrix就是人思想能夠認識到的一切，可問題是身處其中的人永遠無法理解全貌，你必須脫離出來，才能真正理解真相。因此，墨菲斯給到尼奧兩顆藥丸。
選擇紅藥丸，選擇進入真實世界。
選擇藍藥丸，則會忘記一切，回到虛擬世界。
主角當然吞下了紅藥丸。
認識到了“真實世界”——被AI機器人統治的末日世界，知道真相之後，再次回到Matrix的尼奧終於開始感受到了思想的解放。
在“先知”家裡，他看到一個孩子用意念折彎了湯勺，因為在這裡湯勺並不以實體的方式存在，而只是一個理念。
尼奧也可以做到這一點，但是此時的他還沒有獲得完全的覺醒。
直到，墨菲斯為了救尼奧而被抓，尼奧終於理解墨菲斯的信念，執意營救墨菲斯，踏上覺醒之路。
此時的墨菲斯被Matrix的特工程式史密斯拷問。
在史密斯與墨菲斯的對話中，埋下了劇情的一個大伏筆，原來Matrix世界已經經歷了很多個版本。
在營救墨菲斯的過程中，尼奧被史密斯殺死。
但是崔妮蒂一個充滿愛的吻，讓尼奧醒來。
醒來的尼奧，換了一種方式看世界，徹底從Matrix的束縛中解放出來，他的眼中已經不是一個個具體的“物件”了，而是萬物背後的規律符號，他具備了重整Matrix資訊流的能力，例如空手接子彈、空中扮超人……很快就把程式史密斯打成碎片。
這就是“駭客帝國”第一部的劇情。
杜採歌的新版，會保留這個大體框架，但是細節部分會全部改寫。
比如，原版“駭客帝國”的故事是在美國發生的，但是杜採歌的新版裡，場景會更加宏大，因為……因為杜採歌更有錢，經費更充足。
“尼奧”許清雅和她的小夥伴們將在金字塔下追逐，將在熱帶雨林裡戰鬥，將在魔都的鋼鐵森林裡與程式特工交手。
甚至主角的名字都不叫“尼奧”了。
尼奧是英文裡的“The one”顛倒字母順序，“尼奧”這個詞就暗示著主角是救世主。
但杜採歌既然要在華語語境下改寫劇本，當然這些細節都要改變。
許清雅將要飾演的角色（雖然她還沒答應演出，但杜採歌有信心說服她），叫做“易維辛”。
維辛，維新。
代表著變革。
而她的姓氏“易”，其實也有內涵。
想想看，“周雖舊邦，其命維新”。
很容易就讓人聯想到“周易”。
這個梗，在大華國文化輻射圈裡的人就能看懂。
而原本崔妮蒂的角色，依然是女性角色。