當然，對於學生來說，最重要的還是學業。
餘真意去看了一下，書院中的學生，學的都是些什麼呢?
《大學》《論語》《孟子》《中庸》等儒家經典，餘真意每樣都買了一本，打算在路上看。
學子每天的學習時間劃分成起床後、早飯後、午後，晚上四段，每一段都有規定的學習任務。而且既有自學，也有討論，還有先生解惑，還是很很好的。
為了檢查學生的學習效果，書院還有考試製度，主要考查德行和學業兩大方面。每個月有三次小考，考得好的，成績一出來就有物質獎勵，並且還會累積積分，累積到一定程度則升級，也與經濟利益掛鉤。
德行考試的考核標準一般因山長的習慣而定。
例如，老山主主持齊魯書院時時，提倡自覺自勵，不做硬性規定。
而普通的書院，則從更實用出發，對儒家倫常做了具體化的規定。
例如，不尊敬師長、不孝敬父母，就可能受到被除名的懲罰，那種嚴重踐踏院規、破壞倫常的，書院不僅會將其除名，還會報官立案，並永遠不許再入書院。
餘真意覺得，這種制度，非常不錯。
從書院誕生之初，飽含理想主義熱情的讀書人，就希望把書院經營成一方淨土。然而，在與現實的碰撞中，他們最終不得不讓步了。許多原先民辦的書院，就逐漸被官方“收編”。
這種收編，首先是從書院的經費著手。
書院的生存和發展，離不開經費。
而書院經費的來源，多依賴於學田。書院興起之初，私人籌措辦院經費，主要也是靠私人的田產或別人捐贈的田產來供給。然而，僅僅靠捐贈，是不能滿足書院需要的。
因此，當官府開始給書院劃撥田產時，書院沒有理由不接受。民辦書院急劇縮減，越來越多的書院歸到官府手中。
在大唐，書院的常年經費已經由官府一次性撥給。享受政府撥款的書院，花起錢來也大手大腳。例如，為參加正式科舉考試的生員提供一定數量的經費。考生如果科舉得中，更有豐厚獎賞，數目可達五十兩銀子。
不僅考中的生徒有獎，書院的先生也跟著有獎。
書院的辦學經費除了“官助”之外，主要靠民間集資、捐獻和書院創收、自籌，其中“學田”收入是辦學經費的主要來源，每個書院都會盡可能地減輕學生的經濟負擔。
很多時候，學生在書院讀書，不僅不要學費，而且“食宿費全包”。如齊魯書院，學生便“不需一束，均得入院肄業”。另外該書院“更欲立書舍，給膏火，招徠來學，以廣栽培”。
所謂“膏火”，就是學生學習期間的花費，大家俗稱“養士費”。“膏火”原本為資助困難學生的，實際使用時已普遍散發，生徒都有份。或給錢兩，或給糧谷，或錢糧兼給。
書院大多希望所培養出來的學生都是“修身、齊家、治國、平天下”的棟樑之才，所以對學生的要求極嚴。以作息時間來說，不分冬夏，每天早上五時頭鼓，五時半二鼓，六時三鼓上課。
為了使學生都能“好好學習，天天向上”，書院還設有獎勵制度。獎勵的形式很多，既有精神鼓勵，更有物質刺激，如月課獎賞，積分升級。還有所謂的“獎賞錢”、“花紅錢”。
獎懲分明，是書院的基本學規之一。學生在書院不認真學習，不約束言行，也會受到嚴厲的懲處。齊魯書院規定：“學長稽查在院肄業生童，有不勤學勵行者，正言規勸；如其不從，稟明山長，加以懲罰”。