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阿濟格等候的這支部隊，其實就是清軍剛剛組建的前鋒營的火器部隊，一共有一萬名火銃兵，三千名火炮兵。品書網 共有各種火炮一百五十門，其中包括四十門紅衣大炮，另外還有拋石機五十架。
雖然這支隊伍從組建以來，還從來就沒有在戰場表現過其戰鬥力，但從多鐸、洪承疇、阿巴泰等人總結的與商家軍作戰的經驗來看，對付商家軍最有效的，其實還是火器，就是用火器來制火器。現在的阿濟格，也只能把自己的希望都寄於在這一支隊伍身上。
因此這支火器部隊一到，也立刻投入了戰鬥中，火銃兵馬上趕到河邊，取代了清軍的弓箭手，在河岸邊也布成三段連射，和商家軍進行火槍對射，而其他的炮兵則七手八腳，將火炮運到城牆上。
不過一百五十門火炮，由其是其中還有四十門紅衣大炮，每門至少都是在三千斤以上，想全部都運上城牆，也不是一時半會就能完成的工作。而在這時候，清軍的火銃兵已率先和商家軍交上了火。雙方隔著秦淮河，互相都填彈開火，“砰砰啪啪”展開了一陣對射。槍聲頓時響徹秦淮河兩岸，也比先前密集了一倍有餘，而爭奪秦淮河的戰鬥，也進行得更為激烈了。
雖然在以前的戰鬥中，清軍也曾大規模的使用過火器與商家軍進行戰鬥,但主要是用火炮，像這樣有成建制的火槍部隊參戰，卻還是第一次。而清軍的戰鬥方式一下子由中世紀升級到了十五、十六世紀的水平。看來商毅的蝴蝶翅膀，己經扇動了不少的風暴，凊軍的戰鬥方式，居然也開始呈現出跳躍式的發展，而這一場戰場也有了一點真正的火器時代的戰爭味道。
儘管如此，商毅在陣地中用望遠鏡也看得十分清楚，清軍使用的火槍，大部份都是火繩槍，也有一部份是引線槍，另外還有少量的煫發槍。當然儘管淸軍所用的都是最老式的煫發槍，但對這個時代的中國來說，也己經是一個極大的進步了。這也和目前的世界發展大體相當，現在歐州各國其實也仍是以火繩槍為為主，煫發槍的普及，還要等到下個世紀。
雖然是同樣使用火器，但雙方仍然不是一層次，因為商家軍已經是全部使用的火冒撞擊式煫發槍，無論是在射程還是射速，比清軍都高出一個層次。秦淮河雖然不算寬，但在這樣的距離之中，清軍只有煫發槍和鳥銃免強可以夠得上射程，向三眼銃這樣的引線槍，根本就不夠。因此實際上清軍只有七千多人可以投入戰鬥中。
而在發射頻率上，雖然雙方同樣都是三段連射，但在一分鐘內，清軍最多隻能射擊四到五次，而商家軍卻可以達到九到十次，這不僅反是因為煫發槍的填彈速度更快，而商家軍在使用火槍的經驗和戰場適應性上，也比清軍要強得多。畢竟在真正的戰場上填彈射擊和平時的訓練是兩碼事，現在的商家軍，基本可以在戰場上發揮出平時訓練的九成水準，而清軍最多隻能發揮出六成。
再加上商家軍中還有三十二架管風琴槍，除了填充速度慢這個弱點之外，可以管風琴槍己是這個時代最強的陸軍武器了，因此雖然清軍的火銃兵加入了戰鬥之後，儘管在聲勢上打得到是很熱鬧，但在實際的效果上，仍然沒有多少起色。
但就在這個時候，清軍的火炮終於開始發威了。雖然淸軍的火炮並沒有全都運上城牆，但也完成了大半，紅衣火炮也運上來了二十多門，因此阿濟格也下令，先運上城牆的火炮首先開火，向秦淮河北岸發動轟擊。
清軍進攻的重點當然就是秦淮河防線體V形底部地帶，而且在一百五十門火炮中，至少有一百門以上，夠得上射程。而四十門紅衣火炮，當然是都夠得上的火炮之列。
“轟——轟——轟——轟——”
南京城牆上發出了驚天動地的巨大轟鳴聲，將一顆顆炮彈狠狠的砸向了秦淮河北岸，也使在開戰以來，淸軍首次在聲勢上壓倒了商家軍。
雖然清軍的火炮使用的都是實心彈，而且精準度也十分有限，但卻是在這一戰中，終於能夠對商家軍造成實質性的危脅了。一顆炮彈呼嘯而過，落到秦淮河的北岸，帶出巨大的力量，砸向對岸的建築和街道，只砸著瓦磚粉碎，砂石飛濺，梁斷簷拆，牆裂窗穿，同時當然也砸中了不少的商家軍士兵。
不過商家軍顯然並沒有因為淸軍的火炮參戰而退縮，依然固守著秦淮河的防線，同時一些火炮也調整角度，向城牆上射擊，但因為缺少重型火炮，效果也不顯著。同時又向城牆上發射了幾個霹靂火箭箱，但因為霹靂火箭的精準度不高，因此不是落到城壁上就是飛過了城頭，落到了城外，能夠準確的落到城頭上，並沒有幾支，因此對凊軍的殺傷力度也不大。