而十二房，是指四司的下屬。但是很多房直接對接好幾個司，也不算是某一個司下屬。
首先是軍情房。
掌管各地的軍情，不僅僅分了錦衣衛一部分職權，還有製造軍事地圖。防範軍中間諜任務。當然了，也有防範軍中造反的任務，只是這個事情不好直接說。
軍法房，負責軍法。直接對接下面的各級軍法官，並且組織對犯罪軍官的審判。以及對陣前軍法處置所有案子的複核。
除非在戰時，將領是沒有權力對下級軍官直接軍法處置的。即便是戰時，軍法處置之後，也要存檔的。軍法房會複核的。
軍工房，直接負責軍事工業，直接管理某些工廠。或者與某些生產軍械的工廠建立聯絡，必要時強制他們生產，軍隊所需要的物資。
軍儲房，就是管理倉庫的。包括不限於軍械，戰馬，糧食，被服，煤炭，等等。一切軍需物資都在其中，並肩負一定的運輸任務。
一般來說，軍儲房接到後勤司命令，會下令某軍某部到某倉庫領物資。但是從各地運輸到倉庫，固然可以讓民間承擔相當一部分，還可以徵調某軍的輜重隊承擔運輸任務。
但是總體上不方便。所以在軍儲房下面，有一支專門的運輸軍隊。
對了軍儲房還有與交通部對接，負責軍事運輸問題。
算是與後勤部關係最緊密的部門之一。
訓練房，這是何夕力排眾議提出來的。就是將訓練標準化。制定步兵操典，讓軍隊都有一樣的標準，並時刻改進，與時俱進。
當然了，這與其說是訓練房，不如說是步兵房，原因很簡單。
如果將所有軍隊的訓練，都讓一個房負責，這個房就可以直接上升到司了。或許可以說軍訓司。
但是出於權力制衡的需要，下面軍團營將領們，也不想有一個龐然大物的軍訓司，對他們指指點點。畢竟而今打仗還好，如果不打仗了，訓練就是下面將領重要任務。
於是，在這些人的建議之下，軍訓司沒有成立，而各兵種訓練的事情，分到了各房之中。
騎兵房，炮兵房，海軍房，都是這種情況下的產物。不過，他們還負責各兵種的一些事務，不單單是訓練這一件事。
騎兵房，騎兵作為一個專門兵種，有很多事情要處理，特別是馬匹的問題，簡直不要太多，而騎兵房，與其說是騎
兵房，不如說是軍馬房，這裡很多事情，都是管理馬匹的。
炮兵房，與騎兵房一樣。炮兵房是專門負責炮兵的部門，炮兵房主要負責兩部分，一部分就是大炮的研製，另外一部分就是炮兵人才的培養。