在即將離京前，劉鈞向皇帝提出了辭去湖北總兵一職，保舉自己的部下張山出任總兵。而且還保舉了另一名部下王謙和傅山也出任總兵一職。
湖廣的三鎮加北洋水師，各設一名總兵官。此外，三鎮下，每鎮轄兩師，每師轄三協。每師一萬五千人，每協五千人，六師各設一副總兵，每協設一參將。北洋水師編三個分艦隊，水師設一總兵，下設三個副總兵。
“都是為了指揮作戰方便。”劉鈞回道。
經過這段時間的摸索，劉鈞也發現了原來的那種編制並不太適合現在的戰鬥需要。而臨時設定戰鬥旅的做法，也有不少缺陷。因此，劉鈞打算把新軍重新調整，進行一些改動。
如今這個奏請已經得到皇帝的批准。
劉鈞如今統領著湖北三鎮加北洋水師，一共十萬人馬。
三個鎮每鎮三萬。編成了二師六協。協以下還設有標營連隊四級。
這個新的編組，並不僅僅是改了名字，其最大的變化，就是在協一級。組成合成兵種。單兵種編制最大隻到標，標以上，協師鎮都為合成單位。
一個鎮下轄一個鎮指揮部和三個師外加一個重炮標。
一個師下轄一個師指揮部加三個協另加一個重炮營。
而每個協，則由一個協指揮部，兩個步兵標和一個騎兵營加一個炮兵營。一個輜重營，另外一個工兵連和一個偵察連組成。
一個協五千人，標將近兩千人，而營為六百餘人，連二百左右，隊三十餘人。
原來三四千人的營，大大縮水，但營以上，增加了好幾級。特別是在協一級開始諸兵種合成，步騎炮協助作戰。並配備了輜重營，工兵連醫療連和通訊、偵察連，使得每次作戰，不必再費力的臨時編組兵馬，協一級的部隊可以隨時獨立承擔戰役任務，單獨作戰。
各級指揮部包含參謀作戰部和後勤裝備部，並有通訊連、軍牢憲兵連、警衛連、醫務隊、軍樂隊等。
全鎮編成六個師十八個協，就是十八支獨立的戰鬥群，隨時都能拉出去作戰。不必再經過重組編制，都配有相應的輔助兵種。
這樣的合成兵種。也正是隨著武器發展而來的戰術變化。
原來的車營被取消了，但增加了工兵營，這是為了配合火銃兵和炮兵作戰，給他們挖壕溝建柵欄土牆。甚至為了讓炮兵更好機動，而要承擔開路搭橋的任務。
原本輜重營每車配佛朗機也取消了，輜重營和各標營的兵馬一樣，配備更輕便的步兵榴。原來軍中的各種虎蹲、滅虜、佛朗機、將軍炮等老式火炮全都淘汰。
各協都配有一個野炮營，而各師另配一個重炮營，每個鎮還轄有一個重炮標。而在協以下。每標配一門一百七十斤十二磅步兵榴，做為營級火力支援。每個營，配一門一百一十斤八磅步兵榴。每個連配一門五十五斤的四磅步兵榴。用以作為標營連三級的火力支援。
每協的野炮營，都配有二十門炮，其中四門四磅短加農，兩門八磅短加農，一門十二磅短加農。另外還有四門四磅，兩門八磅，一門十二磅的加農榴彈炮，再加上三門六寸的二十四磅榴彈炮，以及三門門八寸的六十四磅臼炮。
這些協屬炮兵營的火炮重量都較輕，但威力卻不小，尤其是配備了六寸榴和八寸臼大口徑的這兩種炮後，還擁有了很強的攻城能力。
而師屬的重炮營，卻有四磅、八磅和十二磅的長管加農共七門，二十四和三十二磅的加農榴四門，再加上八寸的六十四磅榴兩門，和十寸一百零八磅及十二寸一百五十八磅的臼炮各一門，使得每協都擁有極強的攻堅能力。