在對決中，柯南還知道了當時在保險櫃裡搜查的琴酒，其實是貝爾摩德易容假扮的，意識到伏特加有可能會被板倉卓所騙，貝爾摩德這才在情急之下易容成琴酒阻止他的行為防止自己身份暴露，而易容琴酒而非本尊出現，也是防止板倉卓認出自己。
軟體開發從始至終一直是伏特加在明面上跟進，而貝爾摩德是暗中跟進，因為板倉卓曾見過莎朗溫亞德的面貌，二人還水火不容的大吵一架，無奈之下貝爾摩德只能暗中與板倉卓進行交涉，明面上，則讓伏特加幫助自己監視前者。
現如今琴酒自盡，伏特加死在了赤井秀一的手裡，貝爾摩德死在了朱蒂老師的槍下，貝爾摩德的死，也算是讓朱蒂報了前者殺害自己父親的仇了。
柯南到現在都沒有忘記在那種情況下，貝爾摩德一如那一晚即便不惜自己的同伴死掉，也不對蘭做出真正傷害的舉動，雖然只是從灰原嘴裡聽到了這些，但他知道，這個女人，早就有了對組織的二心，居然隱藏了這麼久。
至於其他組織成員也是死的死傷的傷，除了逃走的朗姆以外，所有黑衣組織的成員無一例外全部落馬，而位於長野縣的組織基地，也全都焚燬在了一片熊熊燃燒的火海之中。
在這其中，被生擒的科學家和工程師數量不在少數，雖然這些人全是醫學界，財經界和政界有關的重要人物，但他們在黑衣組織當中卻都是邊緣級別的人物，即便審訊也很難套出有用的情報。
柯南不甘的皺了皺眉頭，拳頭緊握間神情凝重，到最後，還是讓朗姆那個混蛋跑了，不過好在人工智慧烏丸蓮耶已經被八個蛋摧毀，黑衣組織的老大，在存活了一百四十多年後，終於是真正的離開了這個世界，回到了他本該回到的那個世界。
作為潛伏臥底的水無憐奈因為是裡應外合瓦解黑衣組織的重要角色而身負重傷，但好在生命並無危險，同為臥底的波本安室先生倒是沒有水無憐奈受傷那麼嚴重，可他也掛了不少的彩。
看著柯南的側臉，灰原抱著胳膊，此時的女孩心裡在想別的事情，“這個大偵探也會回到以前的生活了吧，從此以後，世界上再也沒有了江戶川柯南，只有復活的工藤新一，那個平成年代···不，令和年代的福爾摩斯了，而他與我，將不再有任何瓜葛。”
揚起一抹有些淒涼的微笑，灰原知道這一天早晚都會到來，對著柯南說道：“瑪麗阿姨給的資料我會加快進度研製解藥，你不去看看你的小蘭姐姐麼，她可是也為了摧毀組織而立下了汗馬功勞呢。”
知道了曾易容成銀髮殺人魔的貝爾摩德曾經在紐約被工藤新一和毛利蘭救過，灰原深知毛利蘭才是摧毀組織的第三顆銀色子彈，如果不是再次像奇兵一樣救場的毛利蘭，自己和茱蒂老師，都會和這個世界···真正的告別。
“那你呢，以後有什麼打算嗎？”
柯南腦海裡浮現毛利蘭的身影，點了點頭，他看著灰原，問道。
“···”
灰原久久不言，閉上眼又睜了開來，隨意的笑道：“不知道呢。”
柯南沒有說話，他感覺灰原不太對勁的樣子，看著她的臉上多了些惆悵，“如果不回到帝丹小學和孩子們去上課的話，你可以加入證人保護計劃，換一個身份重新生活。”
灰原嘆了口氣，“證人保護計劃，實際上和汙點證人沒什麼區別，我可不想和白鳩舞子那樣換一個全新的名字，灰原哀就已經很好了，還有，相比較這個，我倒是更喜歡做一個無憂無慮並且熱愛科學的小學生。”
說罷，灰原露出了淡淡的笑容，“而且還有一點，江戶川柯南和灰原哀是不可以同時消失的，我覺得現在這樣也挺好的。”
“不過瑪麗阿姨是否會讓你這麼任性就不知道了，我和她接觸的時間比你要長，在我看來，她可不是個好說話的人。”
柯南想起之前赤井瑪麗對自己所說的有關要把灰原帶回英國的事情，當時的她神情和語氣都無比堅決，想到這裡，男孩輕聲道。
灰原顯然也是知道這件事，她再度選擇了沉默。
“好了，相比較操心我，你還是稍微適應一下以後以工藤新一身份重現給世人的樣子吧，我可不希望某一天在破案後上了電視採訪看到你說出啊咧咧，歐卡西索之類的幼稚話語。”
灰原淺淺一笑，調侃道。
“喂喂···”
見到灰原又開始揭自己的黑歷史，柯南無語的苦笑著。