結果沒過幾日就聽到了高陽明軍撤走，不久之後，揚州、抱川撤圍的訊息，稀里湖塗的就拿了勝利。
彼時兵部侍郎宋應昌聽聞李如松要從漢陽撤兵，大驚失色的從義州南下與他會和詢問緣由。
在從李如松這裡聽到了事情的大概之後他也極為憤慨，再看到明軍將士因為斷糧而變得面黃肌瘦之後，他也贊同李如松撤兵的建議。
但是他對李如松說道“天子執意滅倭，將軍今日受挫漢陽城下就要撤回國內，恐為天子不喜。不如就撤回平壤修整，軍糧之事我會代為籌措，再尋良機如何？”
人機是兵部侍郎，是正兒八經的進士出身，自己只是一個武將丘八，肯這麼低聲下氣和自己商量李如松也沒道理甩人臉色，稍稍思考之後便同意了下來。
於是明軍自退回開城之後，再向平壤撤退，最終與2月25日，全軍撤至平壤。
李如松雖然撤兵有自己的理由，但是畢竟忤逆了萬曆皇帝的意思，萬曆皇帝在不久之後將他以述職的名義召其回京，加封其為太子太保，中軍都督府左都督。
但是其實這個時期明朝的五軍都督府權柄早已被兵部稀釋，太子太保有多是虛銜，萬曆此舉實際上是對李如松明升暗降，收了他的兵權。
至於在朝的明軍暫時交由兵部侍郎宋應昌統領，各部將領協助，實際上就是沒人管再朝的明軍了。
李如松會津述職的時候向萬曆皇帝講述了自己退兵的原因，他表示朝鮮徵募不到軍糧其實也不是朝鮮官方的問題，實在是朝鮮諸道已經打爛了。
自去年春季受倭災之後，朝鮮各地便輪番遭受兵災，地理的糧食根本種不出來，朝鮮朝廷自然徵募不到軍糧。
若想保證入朝明軍軍糧，就必須從遼東、從山東運輸糧食。在沒有鐵路和海運的當時，要供應4萬餘明軍人吃馬嚼，甚至還要支援朝鮮朝廷上下，這無疑是一筆非常好大的工程。
萬曆儘管不喜李如松未經請示便領兵回撤的舉動，但是也知道他這麼做確實是為了儲存明軍主力考慮的。
自古以來戰爭打的就是國力，但是眼下的朝鮮不能自給自足糧食，大明海運軍糧也不現實，在缺少軍糧的前提下，縱使前線有再多優勢也是浮雲。
聽完李如松的解釋，萬曆儘管有百般不願，但是也明白朝鮮之戰已經到了不得不和談的地步了。
石星受命宋應昌找機會和日本議和，但是石星也表示如今議和有損朝廷形象，他會緊急運一批軍糧去平壤，讓宋應昌想辦法短時間內搞出一些優勢出來，這樣好和談上佔據主動權。
宋應昌與諸將商議之後，決定採用切斷對面後勤補給的方式，最主要邊是讓大明水師會和朝鮮水師，擊破在釜山停泊的日本水師，阻斷其從日本運送糧食的道路。
同時與慶尚道、全羅道的義兵聯絡，讓他們想辦法切斷日軍內陸的運輸線路。
3月16日，季金帶著經過重振的大明水師200餘艘艦船，在全羅道會和了李舜臣的數十艘艦船，一路向東準備去絕影島剿滅日本水師。
17日晚間抵達巨濟道水軍營地，駐守再次的來島通總等人沒有任何的防備，直接被你打了一個猝不及防。一輪炮射之下，摧毀倭船24艘，自己有2艘船隻因為不識水性觸礁擱淺。
為防止陷入如軍重圍，大明與朝鮮水師當天從巨濟島撤兵，28日再次進攻巨濟島和絕影島，在這裡擊破了脅坂安治所領的倭寇水軍主力，更是截住福船的速度，直接追擊到對馬島外，摧毀倭船45艘取得大捷。
戰後季金詢問李舜臣問道“你曾上書言倭寇水軍船堅炮利，為了這幾日未曾見過你所言的倭寇炮船？”
李舜臣一時之間也答不上來，當時在珍島邊上確實遇到了載有火炮數門的倭寇海船，怎麼到了倭寇水師的大本營反而見不著了呢？
不管怎麼說，季金與李舜臣所領的聯合水師成功擊破倭寇水師，切斷了日本從本土運輸軍糧到朝鮮的海路。
要知道朝鮮八道之中，平安道日本並未拿下，黃海道已經光復，全羅道此前由於小早川隆景要應對明軍主力抽調了大部分軍力，如今又復為義兵所佔。