同舟社揮兵進取蘇州，出動本部直系兵馬共計六個指揮近三千人。
其後，收編降兵，招募大戶私兵和轉戶壯丁加以整編，又增加了一千二百餘人。
適應新的形勢變化，徐澤對部隊進行了新一輪的改編，這次改編幅度較大，主要有三點變化。
一是規範稱呼，所有指揮改為“營”，指揮使改稱“營正”。
這其實是一件很小的事，但意義重大，大宋的指揮本就是“營”，只是相比之下，“營正”似乎比“指揮使”的稱呼降低了檔次。
幾個指揮使卻從中讀懂出了徐澤“去大宋化”的意圖，這是同舟社發展到一定階段的必然步驟。
而且，隨著軍隊的進一步擴大，遲早還要推出營以上的編制，若是死盯著指揮使的位置和稱呼不放，那也太沒出息了。
二是開展各營之間軍官交流任職，如三營的都頭羅二和一營的押官林沖對調。
以陸營為例，來源和成長曆程都不同，
以經歷多重考驗的梁山保丁為骨幹的第一、二營，
在海東郡建設中快速成長的第三營，
由河北軍整編而來的第四營，
執行特殊任務的斥候營，
各營的兵員構成、裝備標準、訓練水平、紀律性和作戰風格上，都存在明顯的差異，統一作戰時，必須綜合考慮這些因素，相互配合的問題也很大。
組織軍官交流任職，就是針對這些現實問題，保證各營紀律性、戰鬥意志和協調配合一致的實際行動。
同時，也是為了打壓軍中正在形成的各個山頭。
在同舟社，除了徐澤，沒有誰是不能替換的，幹得不好或是不想幹，隨時可以將你拿掉。
人才使用上能上也能下，不聽差遣想搞事的，先看看自己頭夠不夠鐵。
三是實行多樣化編制，將營一級定為甲、乙兩種。
徐澤把第二將五百人一指揮的大編制定為甲種營，新編遼籍兵馬則編為三百人一營的乙種營。
乙種營營以下也沒有照搬宋軍的編制，而是採用瀘南整編夷丁的“都—什—伍”的垂直指揮體系。
包含鎮東關水師在內的降兵全部編為四個陸營，營官統一都稱營正。