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魏忠賢一黨被處置後，畢自嚴直接官復原職，擔任南京戶部尚書，在他的任職期間，北京朝廷的諸多動作他還是知道的。
尤其是在皇上支援下，戶部尚書郭允厚對於戶部進行了不小的改動，尤其是之後對於全國那麼多縣的吏員進行的大整頓，更是讓畢自嚴格外的興奮，這一切都是他以前想要做而做不成的。
沒有聖天子，這一切都實在是太難了。
因此當郭允厚將北方數省之地的吏員之事處理完，來到南京城和他進行商議時。
畢自嚴直接就對郭允厚表示了支援，甚至在之後的整頓中，他還親自出手，和郭允厚一同處理了江南之事。
在兩個多月的相處中，兩人都感到志氣相同，一時間甚至引也知己。
原本郭允厚還準備回京後舉薦畢自嚴，沒想到皇上直接將他給提拔上去了，郭允厚也是十分高興，志同道合之人實在是難尋。
他甚至對於之後的稅吏問題也有了很多思考，來到京城到現在的一個月時間，戶部的事情他已經捋順。
在這個過程中，他始終覺得關於吏員之事恐怕到現在還不會結束，皇上恐怕想要治根啊，只是皇上究竟要怎麼做呢？
就在畢自嚴在戶部衙門皺眉沉思時，突然有內侍到來，皇上要在武英殿詔見他。
畢自嚴一愣，皇上不是剛回來嗎，這麼快就開始處理朝政了嗎？
不過皇上能召見自己總歸是好的，自己也應該和皇上商量商量了。
現在地方上的稅吏數目實在是太少了，他們完全承擔不過來現在的重任。同時，據他所知其他幾部也存在這樣的問題，這個問題真的不能再拖了。
畢自嚴走進武英殿後，他才發現原來皇上不僅僅是召見他一個人。
六部九卿都來了，內閣的幾位閣老、五軍都督府的孫承宗、甚至還有錦衣衛指揮使田爾耕也來了，看來今日是有大事情要發生了。
眾人行禮坐定後，彼此看了看，都明白，按照這位皇上地慣例，恐怕是又有大事要發生了，即便是剛來到京城的畢自嚴和王永光也已經明白了這一點，臉色十分嚴肅。
朱由檢開口了：“現在諸位已經到齊了，朕今日召集諸位過來，是想要解決地方上的吏員之事，王愛卿，你是吏部尚書，地方吏員之事你來給諸位愛卿介紹一下。”
“皇上，諸位同僚，我大明治下共有一千四百二十七個縣，諸縣皆有吏員，小縣有數十，大縣有數百人，全國在冊吏員總數七萬兩千三百五十八人。
此次歷時近一年，在皇上的領導下，周大人、郭大人、鄭大人等奔赴全國各地，對全國吏員進行了大規模整頓，結果如下。
處死者六千五百三十六人，流放瓊州者一萬三千一百五十三人，辭退者一萬八千五百二十八人，輕罰者不計其數，到此全國剩下的吏員只剩下原來的一半！
而在這其中原諸縣的戶房最為嚴重，剩下的僅為原來的三分之一。
因此，雖然剩下的吏員多是精明強幹之輩，但是朝廷最近事物繁多，北方的數省之地正在大規模開展以工代賑，西南數省的改土歸流正進行到關鍵時刻，現在地方上的吏員任務極為繁重，這些吏員早已經不堪重負。