袁彭年可憐巴巴看著金堡，求求金堡救他一命，可是金堡也很為難，袁彭年勾結東瀛人，吃裡扒外，而他這一次到柳城來，就是慰問在刺殺活動中倖存下來的將士，金堡楠了喃嘴巴，不知道說什麼，其實他內心，更擔心是他推薦的袁彭年，會失去瞿式耜的信任。
秦楚對東瀛人刺殺行為非常憤怒，不僅僅是他，堵胤錫和張同敞也都是憤怒不已，秦楚更是想到，韃子，東瀛人一個都沒有趕走，就被刺客刺殺，滿腔抱負應該怎麼去實現？
對袁彭年這個叛徒，秦楚也沒有立即殺掉，而是讓吳茂騎上快馬，把袁彭年帶到象州，塞給江臂通，讓江臂通這個老錦衣衛過一把癮。
這一次江臂通並沒有回柳城，他在象州，賓州兩地搞得風風火火，他已經徹底明白秦楚的意思，將象州，賓州兩地，還有衛所下屬的土地全部宣佈為朝廷所有，至於當地的皇莊，則是被下令保護起來，只有皇室才有資格耕種，任何對皇莊有企圖的人，立即驅逐出境。
江臂通聚攏流民，充實衛所和城鎮，不到半個月時間，躲在山溝裡的百姓紛紛回城，還有路過的難民以及從贛州府而來的百姓，紛紛得到安置，象州，賓州兩地聚集一千多戶人家，江臂通還遵從秦楚命令，找到散落在民間的朝廷官吏和讀書人，安排最好的馬車送往柳城，這些人將會成為秦楚政權的有生力量。
眾人對秦楚把袁彭年送到象州沒有意見，倒是陳邦彥對秦楚把袁彭年送到象州有些不滿，這個袁彭年身上有大量可用的情報，他不知道江臂通可是這方面好手，袁彭年在江臂通那裡生不如死。
袁彭年被送走以後，金堡立即向秦楚告辭，他要儘快趕回到瞿式耜身旁，向他求情，祈求救袁彭年一命，還要重新取得瞿式耜信任。
金堡離開以後，秦楚再一次召集全軍將領進行會議，
在會議上秦楚第一次明確司令部框架，以他為司令，張家玉為副司令，陳邦彥為參謀長的三巨頭模式，但是張家玉和陳邦彥每年歲末都要給秦楚彙報工作，暫時在司令部下設三大部門，維持軍隊運轉，分別為情報部，徵兵部，後勤部，以後根據實際情況新增部門。
每個部門部長級別等同於主力師師長，情報部主要框架為一正部長，兩副部長，下設四大司，分別為東瀛司，滿清司，海外情報司，日常情報司，每個司的司長級別等同於主力旅旅長，每個司也是一正三副原則設定，秦楚對日常情報司很是重視，要求日常情報司承擔東瀛，滿清，海外以外的所有情報工作。
徵兵部框架為一正部長，兩副部長，下設兩個司，分別為日常徵兵司，招安司，訓練司，日常徵兵司主要負責在轄區內徵兵任務，招安司則不同，其任務是負責對前來投靠，俘虜反正的徵兵工作，訓練司對新兵進行入伍操練，以及老兵日常訓練，徵兵部在各軍區內都有設立團級別徵兵司，完成每年的徵兵任務。
後勤部框架為一正四副，下設糧食司，器械司，軍醫司，建築司，糧食司負責將各地徵集的糧食進行運輸和儲存，在爆發戰爭時，及時發放到各支軍隊，保證軍隊維持運轉，器械司負責全軍將士鎧甲，武器發放以及維修任務，軍醫司和以前有很大不同，在之前軍隊中，軍醫只給千總以上將領治療，新成立的軍醫司和以前有很大不同，他們對普通士兵和將領沒有區別，對此，秦楚還特意強調死亡率，明確提出對送到後方醫院受傷將士進行無差別救治，不能草菅人命，建築司對軍事要塞，野戰軍營進行搭建。
司令部領導全軍以及各地軍隊，秦楚對軍隊建設很重視，五個主力師分別駐紮在柳州府，慶遠府。
其中第一師駐地柳城，第二師駐地懷化，第三師駐地柳城和慶遠府邊境縣羅城，第四師和第五師駐紮慶遠府，分別在河池以及荔波兩地。
每個師滿編五千人，因為東瀛火器全面超越朝廷火器，秦楚要求訓練司加大對火器的操練，做到和東瀛三八步槍無縫對接，五大主力師組建完畢以後，秦楚對地方上軍隊建設提出議程，按照之前的計劃和構想，每個縣都城裡軍分割槽，但是縣軍分割槽級別和之前設定的團級不同，而是降級為營，每三個縣軍分割槽組成一個團軍區，五個團軍區組成一個旅分軍區，地方軍區主要任務是地方治安，安置傷兵以及配合徵兵部進行徵兵動員工作。
軍分割槽的建設，會使得地方官員分走少部分軍權，為此，陳邦彥建議秦楚，地方軍分割槽將領任命權歸屬於司令部。
秦楚點頭同意，地方軍分割槽框架搭建完畢，張家玉作為副司令，向秦楚請示，各部門部長應該由誰來擔任？
秦楚對三個部長人選早就心有成豬，情報部部長，暫時由江臂通兼任，等徐仁才歸來，再由徐仁才擔任，徵兵部部長暫時由張家玉兼任，後勤部部長由陳邦彥兼任，等找到合適人選，再由合適人選擔任部長。
接下來秦楚最關心，也是他最不擅長的內政，秦楚在石埭，徽州都建立以軍政府為性質的政權，但是從和滿清作戰中，軍政府可以取得暫時優勢，但是從長遠來看，並不是一個可以和敵人打持久戰的方法。
秦楚迫切需要改變，他投奔瞿式耜，拜瞿式耜為師，就是想盡量融入到士大夫階級，獲取士大夫的支援，想獲取士大夫階級，就必須要做出一些讓步，他只要做到對軍隊絕對掌握，可以把地方上部分權利分給士大夫，地方上就暫時由瞿式耜力量來恢復。
而瞿式耜安排在柳城居住的張同敞，就是秦楚最好的人選，張同敞現在擔任桂林府總督，但是卻在柳州府生活，秦楚對他的用意不言而喻，正好可以讓張同敞在當地人脈來治理地方。
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