金聲恆數次想下令軍隊開進贛州府，但每次下令之前，還是忍住，畢竟面對秦楚和他麾下軍隊，他確實沒有必勝之心，況且還有陛下和金聲在看著他，最後還是作罷，任由秦楚事實上佔據贛州府等地。
秦楚在贛州府站穩後，徽州府軍軍民在隨後一個月內，先後抵達徽州府，留在徽州府百姓不足萬餘人，跟著秦楚來到贛州府百姓有三萬餘人，秦楚也終於等來主力部隊，利用在贛州城繳獲清軍銀子和糧草，給全軍將士發放三個月軍餉。
各軍抵達贛州府，秦楚也把指揮部安置在贛州城，在城內召集諸位將領，坐在一起商討贛州府大小政務和軍務，根據贛州府和徽州府地理條件不一樣，秦楚也對軍隊做出新的改變，並且邀請各部門也參加這一次擴大會議。
以贛縣贛州城為指揮部，狼喉營，炮營，七部門和城防軍立即入駐贛州城和雩都城，馬錫駐軍會昌，王獻駐軍瑞金，譚功軒入駐寧都，高田入駐安遠，劉良能駐軍長寧，聆聽陽駐軍定南，各軍入駐縣城後，第一時間收編當地鄉勇，防止地方勢力做大，同時佈置在寧都譚功軒部還要密切注意金聲恆軍隊，防止金聲恆軍隊從吉安府突入贛州府。
各軍入駐後，再安排各部分官員進入各地駐軍，防止各地將領擁兵自重，做好這一切後，秦楚才開始著手擴充狼喉營，狼喉營也終於得到擴建，從之前的三營擴充為五營，曹宇宙為第一營守備，李長刀為第二營守備，郭淵為第三營守備，李挺為第四營守備，第五營和秦楚侍衛隊混編，秦楚兼任第五營守備，副守備為韓三刀，第五營編制最為龐大，共有三千餘人，其餘各營編制為兩千五百人。
狼喉營全軍編制為一萬三千餘人，其他各地軍隊不得超過六千人，超出部分軍隊將會被指揮部調回，各地將領對不得超過六千人這個限制，並無多大意見，因為各地都出現不同貧瘠，也難以承擔六千人以上供給，跟著秦楚到贛州府百姓，秦楚紛紛安置在下屬各縣，將一些無主之地分給百姓。
至於贛州本土派縣城，秦楚暫時沒有插手，這些本土派好不容易有了自己勢力範圍，每座縣城每個月給秦楚孝敬一千兩白銀和一千斤糧草，作為交換，秦楚只是象徵性在本土派佔據縣城安排幾個情報部官員，用來傳遞各地情報。
陛下聖旨也已送到，任命秦楚為兵部左侍郎，兼任贛州府知府，提督贛州府和建昌府軍務和政務，但是陛下並沒有把撫州府給調撥給秦楚，而是把包括撫州府等江西其他各地，都由金聲恆提督，並且把徽州府也交給金聲恆，任命金聲恆為江西布政使司，而池州，寧國，安慶，廬州四府都交給金聲，由金聲提督一切政務和軍務。
隆武帝自身也屬傀儡，對地方勢力做大毫無辦法，也就樂的順水人情，只要是由各地軍閥打下地盤，都下聖旨任命軍閥為當地一把手，金聲也知道這樣做法不對，但是當前也管不了那麼多，畢竟清軍才是頭等大敵，只有儘快拉起忠於朝廷軍隊，等趕走清軍，以後在慢慢收回兵權。
朝廷這樣東一塊，西一塊切割做法，把江西一部分劃給秦楚，又把南直隸一部分劃給金聲恆，目的是讓金聲，金聲恆，秦楚三人相互制衡，以免一家獨大，不過這究竟是陛下意思，還是鄭芝龍意思，眾人三緘其口，明眼人一看就知道這是人為故意的分割，但也都不點破，都在埋頭髮展一畝三分地，以後的事情以後再說。
秦楚正是上任贛州府知府，也開始著手組建建昌府和贛州府明面上官府班子，任命從武昌府興國州跟著他南下李振和沈樸二人，其中李振為建昌府知府，勾皮為建昌府守備，楊巴龍為建昌府推官，秦楚不擔心楊巴龍和勾皮會在建昌府建立自己實力，因為建昌府也無多少人煙，況且兩人上面還有李振壓著，同時秦楚提拔嶽令柒為建昌府遊擊將軍，帶領贛州府兩千鄉勇入駐建昌府，防止建昌府本土勢力做大。
建昌府框架搭建以後，秦楚送李振上任前，給他安排五十個護衛，只給他一個任務，建昌府就是給贛州府吸納難民，充實人口，而另一人沈樸，則是被任命為寧都州知州，和譚功軒一起駐守寧都，防止金聲恆有可能入侵贛州府軍事行為。
贛州府草臺班子也被搭建起來，其中牛光天為贛州府同知，花三娘為贛州府通判，江臂通為贛州府推官，黃紹山為經歷，漁夫為知事，洪群時為照磨，六部門僉事都在贛州府官府掛職，其唯獨徐仁才作為情報部頭子，情報部又有自身獨特性，戰鬥在隱秘戰線，情報部官員沒有在贛州府刑偵部門掛職，對此徐仁才沒有任何不滿，甚至非常感謝秦楚，體諒情報工作的特殊性。
秦楚在贛州府所作所為有張有度，並沒有損害到贛州府本土勢力利益，周福東等人也被秦楚任命為本土勢力所在縣城知縣等官職，反正這些地方，秦楚也沒有能力控制，就讓本土勢力自行發展，不用他來承擔軍餉和糧草，還能夠收上來一部分銀子和糧草，本土勢力也樂於發展自己勢力，他們實在是被官軍和清軍搞怕了，清軍一來，官軍就跑了，官軍跑了，清軍就開始燒殺掠奪，這換誰都扛不住這樣洗劫。
被三番五次洗劫後，本土勢力認為只有建立自己的武裝力量，才能夠在清軍馬刀下獲取一線生機，就是在這種思維下，本土勢力瘋狂擴充兵馬，他們有的是錢和糧草，短短一個月時間，本土勢力依靠掌握五座縣城，竟然擁有三萬多兵馬，這其中有戰力軍隊不足只分之一，大多數人都是臨時徵召雜牌軍，還有一些江洋大盜和死囚犯，作為炮灰也被充斥到軍隊中，這些地方兵馬看起來很多，實際戰鬥力卻非常地下，秦楚對他們所作所為，也是睜一隻眼，閉一隻眼，任由他們野蠻發育。
明軍在江西如火如荼發展，清軍日子卻很不好過，葉臣撤到長沙府後，在這裡稍作停留，準備休整一段時間，然後全軍前往南安府，和劉武元，胡有升等軍隊匯合，從南安府進攻贛州府。