贛州城外明軍和鄉勇端著武器殺入城，城內清軍還有四千多人，在八旗兵指揮下全部龜縮在城內，想和明軍打巷戰，可是秦楚不給他們機會，命令周福東等本土人士去喊話，只要投降，以前投降韃子事情既往不咎，可以選擇回家，也可以選擇加入官軍，要是繼續負隅頑抗，不僅要被殺死，還會連累家人和父老鄉親。
城內綠營兵大部分都是贛州府本地人，有部分還是投降清軍的鄉勇，和明軍那邊鄉勇都是熟人，在周福東喊話後，有一千多綠營兵選擇投降，還有將近兩千綠營兵仍然在頑抗，他們全部集結在贛州府校場，利用這裡防禦設施，和明軍決一死戰。
對於清軍中的死硬分子，秦楚從來不手軟，下令全軍殺入校場，校場清軍被殺散後，全部躲入到巷子中，明軍以街道為目標，逐條街道進行清掃，只要是負隅頑抗者，統統消滅，到這個份上，殘存八旗兵和綠營兵也不再心存幻想，和明軍進行慘烈巷戰，秦楚看著巷戰爆發，有點後悔沒有帶一部分城防軍過來，城防軍可是巷戰好手，遇到清軍躲在屋子裡，直接就是一罈子炸藥扔進去，有點後世特種兵城市作戰味道，不過贛州城綠營兵戰鬥力也不強，經過半天時間清掃，終於消滅城中清軍抵抗勢力，
將城中清軍肅清後，秦楚正式開始全面接管贛州城，城中鄉勇還有四千餘人，被分成三部分，其中以嶽令柒為首一千鄉勇直接劃給李長刀和郭淵部，兩人各自分到五百人，其中嶽令柒為郭淵部副千總，剩下兩千多鄉勇要求迴歸各地地主鄉紳序列，對這些要求迴歸鄉勇，秦楚也沒有拒絕，大方讓他們回去，剩下一千左右鄉勇都是主力被打散的部隊，全部被劃分到曹宇宙部，用來充實曹宇宙部實力。
至於被俘虜兩千多綠營兵，全部被剪掉辮子，這些人怎麼處置，秦楚一時間也沒有好辦法，畢竟他們加入清軍在先，想把他們吸納到隊伍中，恐怕使得軍隊戰鬥力和抗清意志大幅度下降。
周福東卻和秦楚提出一個好法子，這些人都是俘虜，反正也沒啥戰鬥力，還不如都分給各個地主做家奴，可以得到一大筆銀子等補償，還可以和本土人搞好關係，這個方法確實很不錯，要不是楊巴龍一席話，秦楚差點就答應下來。
“大人，這些綠營兵是可恨些，但這麼分掉著實可惜，下官認為何意讓他們去屯田，幫助官府屯田，總比私人屯田更強。”
也正是因為楊巴龍這句話，讓秦楚茅塞頓開，他把大量土地分給老百姓和有軍功將士，真正掌握在指揮部手中土地卻很少，這些土地也都被荒廢，如果有這些俘虜幫忙開墾屯田，這會使得指揮部權利和威懾力大為增加，不僅可以壓制本土勢力，還能夠加強對佔領區域控制能力。
秦楚墜楊巴龍更加信任，也虛心接受楊巴龍建議，周福東又吃了一個憋，也無話可說，誰讓秦楚才是真正朝廷命官呢？
做完這些後，秦楚命令贛州城戒嚴，同時命令徐仁才繼續打探劉良能和楊遇明具體位置，徐仁才率領部下出城而去，有贛州府百姓幫忙，很快就打探到劉良能動向。
劉良能在安遠縣停留半天，又是虛晃一槍，把楊遇明引來後，調轉方向由此一次北上，在新田和情報部官員接上頭，終於知道贛州城已經被秦大人攻佔，任務已經完成，劉良能也就沒有必要再帶著楊遇明兜圈子，直接率軍撤回贛州城，在身後的楊遇明窮追不捨。
當他知道劉良能竟然往贛州城逃竄，心裡那個得意，心想這群明軍也是腦子發糊，竟然往贛州城逃竄，這不是送死的嗎？
在距離贛州城還有半天路程，命令部將去贛州城調動綠營兵，和八旗兵一起夾擊劉良能這夥明賊，結果派去贛州城的部將，剛剛進城就被嶽令柒一刀砍死，他等了半天都不見部下回來複命，心裡有些奇怪，反正劉良能騎兵就在贛州城附近，他的部隊也需要短暫歇息，於是帶著八旗兵直接回城。
此時在贛州城內，一片凌肅之景，在小南門門口，已經完全復原，看不出來這裡不久前發生戰鬥痕跡，秦楚率領全軍將士在城內設下伏擊。
其中曹宇宙令一千將士在東門埋伏，郭淵領兵一千在西門埋伏，其餘將士全部埋伏在小南門，這裡是楊遇明回城必經之路，其他兩們門比較狹窄，從小南門入城，可以直接進入校場，明軍在小南門城門口六百米距離，二十門虎蹲炮已就位，只等清軍入城，大炮齊發，利用虎蹲炮殺傷力及輻射範圍面積大特點，最大限度殺傷八旗兵，其餘士兵全部埋伏在小南門兩側，等待敵軍完全進入小南門，全域性伏兵盡出，將楊遇明等八旗兵關門打狗，全部殲滅。
楊遇明在回城途中一直等待部將回來覆命，卻沒有等來部將，這使得對贛州城是否產生變卦而感到懷疑，他把部隊分成兩部分，第一部分八百八旗兵先進城，等城內安全，剩下一部分再進城也不遲。
贛州城城牆上由明軍和鄉勇假扮綠營兵在城牆上巡邏，留守的八旗兵鎧甲也被換上，從城外看沒有任何區別，當第一批八百八旗兵，昂著頭從小南門進城，秦楚看見清軍分成兩部分，立即下令改變計劃，由劉良能率領全軍騎兵去遊斗城外八旗兵，其餘人以最快速度殲滅入城八旗兵。
八旗兵進城後，城門立即被關上，在城外楊遇明聽見城內炮聲大作，大叫不好，立即率軍衝上去，想從其他兩門支援城內八旗兵，卻被劉良能率領騎兵從東西兩門衝出來，兩千左右明軍騎兵死死擋住八旗兵，也不和八旗兵一對一廝殺，就是利用騎兵高速衝擊力和遊走能力，將八旗兵死死攔在城外，楊遇明不顧傷亡，帶領部下一步一步往贛州城小南門殺去，想盡快救出城內八旗兵。
在城內的八旗兵，被虎蹲炮一頓轟炸，大量將士被炮彈炸開後的碎片擊中，死傷狼藉，炮擊結束後，又被明軍弓箭和火銃洗禮，在最前和周圍八旗兵幾乎斃命，明軍並沒有衝上來肉搏，而是繼續用遠端武器攻擊八旗兵。
八旗兵很快就從慌亂中調整過來，直接衝擊明軍炮臺，在他們面前，李長刀和郭淵帶領鄉勇勇敢衝上來，面對殘餘八旗兵，鄉勇終於一雪前恥，利用人多優勢，痛打落水狗，數千人圍攻八旗兵，八旗兵人少，卻仍舊是以命換命，殘餘四百多八旗兵仍舊是殺死八百多鄉勇，才被全部殲滅。
城內八旗兵被殲滅後，秦楚下令在城內軍隊出擊，城內明軍和鄉勇從城內殺出來，和劉良能騎兵共同出擊，將楊遇明圍在贛州城外草地上，楊遇明遇事不慌，指揮八旗兵和明軍遊鬥，八旗兵中蒙古八旗也有兩百餘人，也都是騎兵，和明軍騎兵交手中，佔據絕對優勢，每一次和明軍騎兵對沖，都能帶走成片明軍騎兵性命。
劉良能那個氣啊，他本人騎術還算不錯，就是手底下騎兵戰鬥力太差，很多人就是騎著馬的步軍，只有極少數騎兵有能力和蒙古八旗一戰，看著越來越多騎兵被蒙古八旗幹掉，他親自帶領二十名騎兵衝擊蒙古騎兵，蒙古騎兵也發現劉良能這一隻騎兵，集體調轉馬頭往劉良能衝來。
劉良能高舉長槍，和身後的部下高喊：“拼了，咱明騎還就不如人嗎？”
秦楚在城牆上看著騎兵表現，很不滿意，和從小在馬背上長大遊牧民族相比較，明軍騎兵就是幼兒園水平，不過他不擔心劉良能安全，因為勾皮和楊巴龍已經率領六百弓箭手，運動到蒙古騎兵對面，在蒙古騎兵衝鋒一剎那，就開始對蒙古騎兵進行射殺。
六百隻箭頭從劉良能等騎兵頭頂飛過，直接飛入蒙古騎兵陣營中，射殺數十個蒙古騎兵，蒙古騎兵毫不畏懼，一輪弓箭並不能阻攔他們衝鋒步伐，早佐領帶領下繼續衝向劉良能，劉良能身邊已經聚集七百多明軍騎兵，他將長槍望天空一舉，下令集團衝鋒，在衝鋒前勾皮又一次下令射擊，第二輪箭雨沒有對蒙古騎兵帶來多大傷害，但是得蒙古騎兵速度有些放緩，這一來一去時間，劉良能率領明軍騎兵卻先殺入蒙古騎兵中，雙方騎兵對騎兵，蒙古騎兵被明軍騎兵夾在中間，失去衝擊能力，只能是騎在馬上和明軍互砍，明軍騎兵又得到鄉勇支援，在騎兵和步軍攻擊下，兩百蒙古八旗兵紛紛授首。
楊遇明還在指揮滿八旗和漢八旗繼續對抗明軍，但是隨著蒙古八旗全軍覆沒，明軍騎兵主力再一次殺入戰場，滿八旗兵和漢八旗兵被輪番衝擊，不斷有士兵被成群明軍砍成屍塊，八旗兵拼盡全力，還是未能阻攔明軍步步前進，明軍前鋒已經殺到距離他只有五十多米距離，他再也坐不住了，拋棄部下秘密突圍。
楊遇明秘密突圍，卻逃不過明軍眼睛，秦楚下定決心殲滅楊遇明這隻軍隊，沒有殺死楊遇明或者俘虜他，他可以去贛南地區召集軍隊來攻擊贛州城，所以秦楚下達必殺令，明軍中騎兵瘋狂追擊楊遇明，楊遇明部下已經被明軍消滅殆盡，身邊沒有一個部下保護他的安全。
而他知道自己必須要逃出去，為了躲避明軍追擊，並沒有向贛南趕去，而是往南安府尋找劉武元，向劉武元尋求幫助。
他一人一騎，不停地敲打馬屁股，只要逃到南安府，就還有東山再起機會，贛州府只有贛州城和雩都城被明軍佔領，其他各地還在清軍手中，向劉武元借兵，還可以反敗為勝，他也不可惜戰死在贛州城八旗兵，只要能夠逃回去，就還能帶回來大批八旗兵和精銳綠營兵打回來，在逃跑路上他發誓要復仇，不殺死這群明軍他這輩子誓不為人。