約兩萬年前，無極汰那伴隨隕石墜落到迦勒爾地區。其所洩露能量扭曲了周圍的時空，散發的能量令迦勒爾地區的神奇寶貝出現極巨化現象。
兩萬年前，人類製作的土偶在偶然照射到奇異的光線後突變成念力土偶。
一萬年前，冰河時代末期，象牙豬開始繁榮興盛。冰河時代結束後，全球氣候變暖，象牙豬的數量大量減少。
某個時期，泥偶小人被人類運用超古代文明的力量製作出來。
3.中古時代
數千年前，在鐵器時代之後，雷吉奇卡斯被封印在神奧地區的切鋒神殿。雷吉洛克、雷吉艾斯、雷吉斯奇魯分別被封印在豐緣地區的各個遺蹟之中。
大約3000年前，卡洛斯地區發生了戰爭。在這場戰爭中，卡洛斯的王AZ失去了自己心愛的花葉蒂。為了讓花葉蒂復活，AZ發明了“最終兵器”。
“最終兵器”釋放出的能量使AZ和花葉蒂得到了永恆的生命。雖然復活成功，但憤怒的AZ又向戰爭雙方復仇。用“最終兵器”毀滅了一切，給卡洛斯地區帶來巨大的災難。
而花葉蒂得知“最終兵器”是犧牲了大量的神奇寶貝而驅動的之後，失望的了離開了AZ。
再次失去花葉蒂的AZ痛苦萬分，但永恆的生命讓他無法自盡。於是痛苦的AZ便踏上了尋找花葉蒂的流浪之旅。
2500年前，合眾地區古代城堡建成。
約1500年前，最早的文字出現在城都地區的阿露福遺蹟、七之島的阿斯卡納遺蹟以及神奧地區的隨意遺蹟中。至今考古學家還不能確定未知圖騰和這種文字哪個出現的更早。但顯然它們之間存在有某種關聯。
同時期，大蔥鴨因為過度捕獵而減少。鯉魚王的種群發生突變，基因變得菜的摳腳。
約800年前，哲爾尼亞斯和伊裴爾塔爾在卡洛斯地區陷入沉睡。
4.近代
約700年前，鈴鐺塔和鍾之塔在圓朱市建成。兩座塔象徵著寶可夢和人類的友誼，洛奇亞與鳳王棲息於塔頂。
約500年前，阿佐特王國的天才科學家艾利法斯製造出瑪機雅娜獻給了王室，與當時的公主一起生活。
約300年前，當時的卡洛斯國王為了炫耀自身權力，建造了巴爾法姆香殿。
約150年前，鍾之塔被雷擊燃起大火。洛奇亞飛去了漩渦列島，有三隻寶可夢在大火中喪生。大火熄滅後，鳳王出現，讓三隻被燒死的神奇寶貝復活，稱為傳說中的三聖獸：炎帝、雷公、水君。
大約在同時期，第一場神奇寶貝聯盟大賽舉行。
約100年前，電石洞穴開始出現齒輪兒。
1925年，寶可夢學的開創者——西野森博士進行了一場抽取火暴猴憤怒能量的實驗。但年邁的教授搞錯了火暴猴的用藥劑量，使火暴猴變得過度衰弱。或許使出於生存的本能，火暴猴縮到了教授的老花眼鏡盒裡。像胎兒一樣，團成了圓形。
這次事件成為了寶可夢捕獲膠囊開發的契機。
之後又經過了數次改良，最終成為了市面上販賣的現代精靈球。
5.現代
現代發生的事件就是各個遊戲內的主要劇情，不多贅述。