期間，故勒頓與摩托蜥一直生活在牧場當中。
直到九年後的今天，也就是聯盟歷206年，奧琳博士與弗圖博士為了保護故勒頓去世。
因為他與兩位博士的交情，繼承了兩位博士記憶與情感的Ai向他尋求幫助，請求他過來關閉時光機。
因為他的鬆懈疏忽，導致了摩托蜥墜入了時光機，在過去經歷了數萬年，終於找到了太樂巴戈斯。
過去的太樂巴戈斯與未來由太晶能量建造而成的時光機產生了共鳴，而後變成故勒頓的摩托蜥被呼喚了回來。
但是聯盟歷198年的兩位博士與聯盟歷206年的博士Ai同時在呼喚故勒頓。
兩個不同時間點的未來在同時呼喚位於過去某個時間點的故勒頓，導致故勒頓差點被兩股不同的時空能量給撕碎。
而最後知道一切的他最終選擇了放手，親手將變成故勒頓的摩托蜥送回了聯盟歷198年，送給了過去的自己。
至此，閉環已成。
但現在，他又發現了本該滅絕的太樂巴戈斯仍然存活於世。
如果太樂巴戈斯們沒說錯的話，他將會在未來的某個時間點回到過去，去陪伴過去時空的摩托蜥。
並將太樂巴戈斯族群從被滅絕的命運中拯救出來，然後讓它們在大空洞中沉睡到聯盟歷206年，被現在的他發現。
直樹滿臉苦澀，這還真是一個完美閉環啊！
罷了！已經發生的事情無法改變，現在最重要的，是將悖謬寶可夢所帶來的危機給徹底解決。
這樣一來，他才可以保護好在帕底亞地區生活的家人與朋友。
直樹帶著故勒頓回到了電梯前。
就在他想要登上電梯的時候，故勒頓卻忽然看向了不遠處：“啊嘎嘶？”
直樹順著它的目光望去，接著就在一張落滿灰塵的桌子上看到了一本筆記。
那是……
直樹愣了愣，隨即上前拿起筆記，拍掉上面的灰塵，發現這似乎是奧琳博士留下來的與這處地底大空洞有關的研究資料。
【在第零區的更下層存在著巨大的空洞，而太樂巴戈斯零之秘寶就沉睡在那空洞的最深處，變為結晶體的身體保護著它不受外敵侵襲，只是它似乎需要一些時間才能甦醒過來。】
【不知是不是受到太樂巴戈斯的影響，大空洞內正在發生地面上前所未見的太晶化現象，囊括所有屬性的太晶我決定暫時把這種太晶屬性稱為星晶。】
“星晶？”一個從未聽說過的名詞，直樹有些疑惑。
他繼續向下看去，試圖從中找到相關資料，但可惜的是，奧琳博士並沒有過多的敘述。
下面則是變成了對零之大空洞的調查。
【我們將比第零區更下層的區域稱為零之大空洞，從地層來看，我推測這個空洞大約形成於200萬年前。】