V99檔案的真相，終於在所有人面前，被掀開了一角。
蒼邊惠美從其父親好友西崎先生那裡，瞭解到了部份三年前的真相。
西崎先生不僅是蒼邊惠美父親的同學兼好友，還是三年前，一起在66號研究所中工作的同事。
不同的是，蒼邊惠美的父親沒能逃脫，西崎先生卻僥倖逃得一命。
只是倖存下來的西崎先生，如今很少與外人溝通，顯得格外孤僻，好似是受到了那場事故的影響，留下了永久性的創傷。
西崎先生最終還是選擇，將三年前的真相，告知蒼邊惠美。
或者說，這是遲來了三年的見面。
三年前，各個領域的科學家們，被召集到岐阜山裡的一座研究所裡，也就是宇宙裝備研究所，第66號實驗設施。
目的是修復從美國運來的巨大裝置的殘骸。
根據研究，那是一個可以生成蟲洞的系統，能夠連線地球與銀河的盡頭。
在科學家們的努力下，修復工作順利完成，並且啟動了裝置。卻沒想到在裝置啟動不久後，蟲洞失去了控制，開始吞噬周圍的科學家們。
身為計劃的負責人，蒼邊惠美的父親，蒼邊樹，就在蟲洞的中心位置，當場被蟲洞吞沒。
西崎先生能夠倖免於難，是因為他負責在外圍監控室裡觀測實驗，才僥倖逃得一命。
之所以說西崎先生與蒼邊惠美的見面，是遲到了三年的會面，是因為早在實驗的前一天，蒼邊樹就為了以防萬一，將一樣遺物交給了西崎先生，如果他出了什麼事的話，就將遺物轉交給蒼邊惠美。
然而，在實驗之後，察覺到防衛隊的態度後。
西崎先生意識到，這次的實驗很不簡單，如果他將蒼邊樹的遺物交給蒼邊惠美，很有可能會引起防衛隊的相關人員的注意，將蒼邊惠美捲入到危險之中。
因此，西崎先生決定獨自保守秘密，逐漸遠離人群，變得沉默寡言。
直到蒼邊惠美找上門，一開始西崎先生是不願意將蒼邊惠美捲入其中的，但最後，西崎先生還是想明白了。
既然蒼邊惠美能找到他，就代表蒼邊惠美已經在調查那件事了，縱使他什麼都不說，蒼邊惠美也會遭遇危險。
還不如他將自己所知道的一切，告知蒼邊惠美，希望能助蒼邊惠美一臂之力，縱使真的遭遇危險，也能有機會抓住一線生機。
順便將其父親的遺物歸還給蒼邊惠美。
看起來作為間諜，見識過最多黑暗的蒼邊惠美，實際上才是那個，被保護的最好的人。