最早倭寇鬧得是越來越厲害了，一股僅有五十三人的倭寇從浙江沿海登陸後，連續攻掠杭、嚴、徽、寧、太平等州縣，最後直逼到了金陵城下，並大張旗鼓地開始組織攻城。
這群倭寇打到南陵時，南陵縣曾派出三百官兵守城，倭寇衝潰守兵，並衝進縣城縱火焚屋。縣城周邊三個縣府的官員率兵來援，交手時，官兵紛紛對著倭奴放箭，這倭寇竟然空手接住了射過來箭，三百官軍一看這還打個屁啊，發一聲喊一齊就跑。
可是要知道，金陵乃是我太祖洪武爺的都城，建文年間惠宗即位時依然立都於此。後建文與成祖不合，兵刃相見，成祖爺得勝後，才遷都北京，從此金陵成為留都。
然而，其政治中心的功能雖然被削弱，卻依然保留著完備的行政系統、高大的城牆和數以萬計的駐軍。
在這其中，南京城牆，可是天下聞名的。據說，當年一代首富宋萬三為討好朱元璋，花巨資捐修此牆。而且為了保證工程質量，每一塊牆磚上都刻有磚的原產地，一旦出了問題，千百年後依然可以追責。由此可見，整座城牆質量十分了得。
可眼下，面對這城高牆厚、質量了得的南京城城，區區五十三人組成的倭寇小分隊就敢組織進攻？要知道，當時南京城內的守軍少說也有一萬多，而且還不包括周邊地區的援軍。按一般的理解，倭寇此舉無異於以卵擊石。
但最終戰況，卻令人驚掉下巴！
就是這麼五十三個小賊。南京守軍與之打了兩回，倭冠居然殺了二名把總指揮，還斬殺明軍士卒八九百人，自己連個受傷的都沒有，就這麼從從容容地走了！
金陵十三門緊閉，傾城百姓皆點上城，堂上諸老與各司屬分守各門，雖倭奴都不知道跑哪去了，可是大家依然不敢懈怠。小蠻與景墨也上了牆頭，聶小蠻都快氣暈過去了，這堂堂的金陵城竟被幾十名小賊圍得不出進出，實在是千百年來聞所未聞之恥。
五十三個倭寇在大批官兵追擊下，越過武進縣境，抵達無錫慧山寺，一晝夜狂奔一百八十餘里！
這夥倭寇之所以最後落入官軍的包圍圈，還有兩個老百姓的功勞。當時這夥倭寇到了無錫，因為勢單力薄，想取道常熟，去和柘林的另一股倭寇會合，就抓了兩個當地人走在前面做嚮導。常熟在無錫北面，這兩個人卻故意領著他們往南走，一路上遇到路人就悄悄告知說：“倭寇到了，你們趕緊報告官軍，他們已經陷入絕地，快來擒拿！”
倭寇最後走到了蘇州，落入了官軍的羅網，而這兩個“英雄義民”最後竟慘遭倭寇亂刀分屍，實在是可發一嘆。
這些疲敝到了極點的倭奴到了蘇州滸墅關，已經註定插翅難逃。蘇松提督曹邦輔、副使王崇古率領僉事董邦政、指揮張大綱、把總婁宇等，督率數千官兵佈下了天羅地網。
陸地上、太湖邊都佈下重兵。曹邦輔是嘉靖年代素有“知兵”之名的大臣，後來還負責薊遼等地的軍務。他親自出陣，重兵佈防，殺雞用牛刀，完全是因為這群倭寇太過猖獗的緣故。
以逸待勞的官軍終於和倭寇正面接戰了，在曹邦輔的嚴令下必須死戰，不死陣前，便死於軍法。吳林廟猝然相遇，官軍奮勇上前擒斬了二十七人，剩下的倭寇逃走到靈巖，奪了幾艘民船準備從太湖逃走，不料見到太湖上的官軍船隻和旗幟，沒敢渡過去，棄船步行到了橫涇前馬橋，躲進一間民舍。
官軍團團包圍民舍用火攻，倭寇抵擋不住拼命殺出一條血路，跑出一大段路後，散開藏在田禾中。官軍四處找尋不得，都以為他們逃走了。就在這時，一個官軍頭目武生車梁用手摸了摸地上一具倭寇屍體，發覺還有餘溫，知道倭寇沒逃遠，又看見田裡“草露微動”，就讓手下官兵齊聲大喊：“賊人躲在田裡！”這招打草驚蛇果然有效，喘息未定的倭寇果然受驚奔出，被悉數擒殺，沒有一人逃脫。
這一夥倭奴雖死，卻留下太多謎團，他們行程數千裡，不掠財、不奸~淫、不殺平民，官兵傷亡四五千人，殺死明朝一御史、一縣丞、兩個指揮、兩個把總，最後全軍覆沒。在異國他鄉，這種自殺式攻擊的目的何在？
而諸多州縣的人民，都把金陵當作了避難的天堂，竟扶老攜幼像潮湧似地趕來。這些逃難百姓的心中，都盼望著戰亂早日結束，別的事都不足以引起他們的興味。