大軍遲遲沒有動作，表面上看是因為作戰計劃的重大改變，以及朝廷徵收剿餉等等因素，其實真實的原因一直都在兵部左侍郎陳新甲的內心，抵達湖廣武昌府之後，陳新甲採取了一系列的辦法，基本掌控了剿滅流寇的指揮權，五省總督孫傳庭儘管內心不舒服，但胳膊扭不過大腿，也只能夠任命，加之在這段時間之內，陳新甲與內閣大臣、兵部尚書楊嗣昌之間的聯絡非常的頻繁，兩人各方面觀點的認識漸漸趨於一致，這遠不是孫傳庭能夠比擬的。＠樂＠文＠小＠說|（ 閱讀最佳體驗盡在【】）
陳新甲不笨，有著一定的能力，他很清楚皇上要求兩面出擊剿滅流寇的決定，是不符合實際情況的，若是按照這樣的方式去剿滅流寇，很有可能導致不可預見的結局，要知道李自成和張獻忠已經變得很是強悍，朝廷大軍只能夠採取打擊一路、穩住一路的做法，才能夠達到削弱流寇的力量、最終剿滅的目的，這就好比是小孩子走路，剛剛在地上爬的時候，你可不能夠要求他跑步甚至是下海游泳。
孫傳庭提出來的作戰計劃，陳新甲經過了仔細的研究，結合他到湖廣看到的實際情況，認為的確是可行的，但認同孫傳庭的作戰計劃，也是不行的，畢竟皇上有聖旨，已經否定了孫傳庭提出來的作戰計劃，如此的情況之下，陳新甲就需要找到變通的路子。
他曾經提出來兵分兩路打擊李自成和張獻忠兩路流寇的作戰計劃，甚至如何的排兵佈陣都做好了，但結合實際情況，他徹底否定了自己思考出來的計劃，他認為孫傳庭麾下的近十萬大軍是不能夠兵分兩路的，必須要集中起來，打擊李自成或者張獻忠任何的一路流寇，且其他協助作戰的衛所大軍，必須要阻止兩路流寇的聯合。
朝廷徵收到的剿餉，源源不斷的撥付到湖廣。大軍的糧草得到了充足的保證，已經沒有任何理由不出擊了。
時間到了八月下旬，陳新甲找到孫傳庭商議，透露出來改變原來作戰計劃的意思。
經過了幾次的商議和思索。兩人的意見慢慢趨向一致，總體的作戰計劃終於確定下來了。
湖廣總兵左良玉、松江總兵劉良佐，以及調遣到河南出任總兵的賀人龍，湖廣巡撫方孔炤、河南巡撫吳甡，以及五省總督孫傳庭、監軍王永吉、兵部左侍郎陳新甲。齊聚湖廣巡撫衙門。
牆上掛著兩張醒目的地圖，屋子中間還擺著沙盤，不用看就知道是要商議討論什麼事情。
陳新甲站在沙盤的旁邊，侃侃而談。
“諸位大人，李自成和張獻忠兩路流寇肆掠湖廣與河南，張獻忠佔據了襄陽府、鄖陽府，還準備進入到四川，李自成佔據了南陽府和汝寧府，為了能夠儘快剿滅流寇，還北方安寧。皇上是殫精竭慮，朝廷決定徵收剿餉，讓大明百姓暫且忍受一年之時間，就是為了能夠保證大軍糧草充足，為了大軍徹底剿滅流寇。”
“本官與孫大人多次商議了作戰計劃，也進行了數次的修改，最終做出了決定。”
說到這裡，陳新甲看著孫傳庭，再次開口了。
“請孫大人部署作戰計劃。”
陳新甲居然沒有親自部署，讓孫傳庭來安排。這個情況讓眾人吃驚，在他們看來，陳新甲和孫傳庭之間是存在矛盾的，重點就是為了作戰計劃以及作戰指揮權的問題。眾人也清楚，不管是從身份地位，還是從背景方面來說，孫傳庭都是弱於陳新甲的，陳新甲指揮大軍作戰應該成為了定局，說不定孫傳庭被直接排出在外也不稀奇。
孫傳庭站起身來。走到了沙盤的前面，他的背後就是兩張醒目的地圖。
“諸位，今日之作戰計劃，就是大軍下一步具體作戰的計劃，本官希望諸位不要有絲毫的洩漏，若是此作戰計劃洩漏出去，那是一定要追查到底的。”
孫傳庭的這個要求，讓眾人的神情變得肅穆起來，公佈作戰計劃，就意味著征戰廝殺馬上就要開始了，其實這也沒有多大的稀奇，河南巡撫吳甡以及河南總兵賀人龍悉數都趕赴湖廣武昌府，就已經表明不一般，要知道賀人龍出任河南總兵，是在七月底，且趕赴河南上任的時候，從南京京營帶走了兩萬軍士。
“作戰依舊是兩路出擊，第一路大軍由陳大人和本官指揮，松江總兵劉良佐、湖廣總兵左良玉跟隨作戰，第一路大軍作戰之目標是盤踞襄陽和鄖陽等地的張獻忠。。。第二路大軍有河南巡撫吳甡大人指揮，河南巡撫賀人龍參與，其作戰目標是盤踞在南陽府和汝寧府的李自成。。。兩路大軍要按照統一的要求，協調作戰。。。”
孫傳庭部署作戰計劃的時候，眾人的臉上沒有多少吃驚的表情。
陳新甲的臉上閃過一絲的微笑。
當初感覺到兩路作戰行不通的時候，陳新甲苦思冥想，終於想到了南京京營的總兵賀人龍，賀人龍的名氣是很不錯的，也曾經多次參與針對流寇的戰鬥，讓流寇頗為恐懼。