伏羲大獲全勝，正得意洋洋。九天玄女現身，親自引路，帶領伏羲前往九重天外。伏羲這才知道，原來天外存在天機法網，困鎖元祖天魔。伏羲以意念感應天機法網內部情形，和元祖天魔火拼一招。雖然僥倖逼退天魔，但伏羲自己，卻傷得更重。不但招毀吐血，兼且肉身受創，元氣大傷。
伏羲這才知道，元始天族捨身封印天魔。諸天仙神，定下嚴苛規條，禁止任何存在接近，也只是忠於職守，迫不得已而已。而伏羲屠殺天界諸神，致使道消魔長，更是罪孽深重，自覺萬死難辭其咎。
但九天玄女卻安慰伏羲，勸他以十方俱滅和本身的大智慧，幫助天界守護法網，將功抵過。
伏羲重返人間，隱居起來，專心鑽研八卦術數。雖然八卦確實博大精深，令伏羲參透之後，能夠知曉過去未來。但天際無限，未來變數紛擾。所以也只能約略知曉千年之內的大概。
元靈離體，神遊物外，投身未來。一切彷彿身臨其境。伏羲看見了，元祖天魔終於破困脫身，回覆自由。大肆屠神、誅仙、滅聖、無可匹敵，勢不可擋。繼而更下凡作惡，瘋狂屠戮，毀天滅地，殘害蒼生，魔染乾坤。
伏羲元靈，目睹慘況，震撼之極。元靈歸竅，慄然驚醒。此時九天玄女再度下凡，求問解救天地劫數的方法。伏羲殫智竭慮，終於想出定數由天，變數則從十方俱滅而來。可以利用十方俱滅，在大地佈置玄機奇陣，和天機法網相互呼應，煉化天魔戾氣。
玄女欣賞伏羲的大智大慧，同時也有責任鎮壓天魔，於是決心出力相助伏羲。士為知己者死，伏羲於是和九天玄女一起，雲遊四海，尋訪呼應天機法網的最佳位置。
伏羲聖人，九天玄女，一人一仙，以十方標準定向，到處遊歷尋訪，途徑名山大川，盡是如畫風光。得到這位漂亮女仙相伴，把臂翱翔，是伏羲一生之中，最快樂逍遙的時光。
不久之後，他們到達了南方苗疆地域。現此地囤積了十濁一清的戾氣，正是天機法網最脆弱的位置。魔氣已經外洩下沉，導致無數毒蟲毒蛇，怪禽異獸，都喜愛盤踞在此。
雖然和玄女相伴的日子已經結束，讓伏羲感覺沮喪。但他仍以天地安危為重，於是放下雜念，一心繼續除魔大業。但要成功布置好玄機法陣，仍然需要兩件神物。先，就是天神兵：驚邪。
伏羲和雷公電母，積怨極深。但為了除魔大業，伏羲毅然前往求懇。經過一輪波折，雷公電母終於被伏羲的大義所感動，化解了彼此恩怨。更贈予雷叉電剪，合併成天神兵驚邪，幫助伏羲，佈置奇陣。
驚邪已經到手。接下來，伏羲就要求取西王母的“瑤池聖水”。那是天地間最純潔無瑕的事物，也是天地萬水之源。
天地初開，混沌洪荒之中，本來並沒有水。但西王母的瑤池，卻能吸收天地精華，經過百年時間，就能凝結出一滴聖水。聖水再經煉化，潔淨成雲，廣播於天地之間，形成雨水。大地吸收了雨水，才有生命誕生。
但聖水本身，卻只可遠觀，不能近褻。曾有七位仙女，一時興起，喝下聖水。笙歌舞樂七晝夜，變成了銀雕塑像。
聖水的純潔和靈氣，擁有阻止天魔茁壯，煉化魔氣的作用，具備神懼魔驚之靈能。伏羲就要投身聖水之中，讓大智慧與天地共存，操控十方俱滅，捕捉乾坤變化，形成滅邪玄網。但此舉等於捨身成仁，令玄女大為感動，淚水控制不住地滾滾淌下。
伏羲大義凜然，囑咐九天玄女在自己成仁之後，到天地陰陽異域之處，尋找陰陽奇木，製成木盒，安放雷叉電剪，以驚邪的電力。推動滅邪玄網運作。
一聲紅塵永別。伏羲高舉十方俱滅，躍入瑤池之中，被聖水包裹成球，緩緩飛昇。成為了能夠預知過去未來，控制十方俱滅運轉滅邪玄網的——大智慧聖球。
緣分已盡，大智慧聖球和九天玄女永別。受伏羲的大仁大義影響，千年之後，九天玄女奉命下凡，幫助軒轅黃帝對抗蚩尤的時候，玄女也終於追隨伏羲後塵，捨身躍入烘爐。
九天玄女以本身玄陰真靈，中和南北精鐵的剛硬。終於成功製造出天神兵太虛。黃帝和蚩尤一戰之下，蚩尤遭遇虎魄反噬落敗，肉身化為飛灰。
但冥冥之中，一切自有天數。蚩尤雖然間接因為伏羲而死，也因為伏羲而蘊生出復活之機。世事玄奇，莫過於此。