這時商毅還沒有收到海軍艦隊發回的訊息，但他一直都在考慮，下一步將對南陽、徐州、濟南三方的那一方發動進攻。
在一開始,商毅傾向於首先向南陽發動進攻，因為清廷在南陽的兵力相對薄弱，而且離北京也要遠一些，這樣對中華軍相對更有利，雖然商毅也確信，中華軍的實力在清軍之上，但這次出兵，是對清廷展開全面進攻，不同於以前的了防守反擊或是戰略反攻，因此商毅還是打算選擇比較穩妥一點的方案。
而且攻下南陽之後，向西可以進取關中，向東可以攻佔河南，向北可以直攻山西，可以四面出擊，迴旋的餘地也大一些。
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在起義軍進攻淄川縣的時候，濟南的阿巴泰也派遣人馬，平定這次叛亂。品書網 和清軍的正規軍相比，起義軍的戰鬥力就明顯要差得多，因此起義軍雖然攻克了淄川縣之後，但清軍也相繼收復了高苑、新城、長山等縣、各地的起義軍均被清軍殺得大敗，兵力損失也超過了半數。
而謝遷等起義軍首領商議之後，決定集中現有兵力，駐守淄川縣，然後向青州的中華軍求援。
其實在謝遷起義一爆發的時侯，山東軍區的周少桓就己經收到訊息，他一面下令，分派各軍集合兵力，準備戰鬥，一面也向南京發出報告，建議借這次謝遷起義的機會，向濟南、兗州一線發動進攻，擊敗阿巴泰部的清軍人馬，攻佔山東省全境。
這時商毅還沒有收到海軍艦隊發回的訊息，但他一直都在考慮，下一步將對南陽、徐州、濟南三方的那一方發動進攻。在一開始,商毅傾向於首先向南陽發動進攻，因為清廷在南陽的兵力相對薄弱，而且離北京也要遠一些，這樣對中華軍相對更有利，雖然商毅也確信，中華軍的實力在清軍之上，但這次出兵，是對清廷展開全面進攻，不同於以前的了防守反擊或是戰略反攻，因此商毅還是打算選擇比較穩妥一點的方案。而且攻下南陽之後，向西可以進取關中，向東可以攻佔河南，向北可以直攻山西，可以四面出擊，迴旋的餘地也大一些。
但接到周少桓的報告之後，商毅也意識到，現在山東確實出現了好機會。因此也開始考慮先打山東的方案。不過一但中華軍佔領了山東，等於是將清廷給攔腰截成兩段，同時可以直接危脅到北京地區，也就意味著將和清廷展開全面決戰。中華軍是否己經做好了這個準備，商毅心裡也還拿不定把握。
而使商毅最終下定決心，發動進攻山東的戰役，是在兩天以後收到了聯合艦隊大獲全勝的訊息。
收到了這個訊息的時候，己經是傍晚時分，商毅吃完了晚飯，正和妻妾們一起陪著兒女們一起玩。這時衛兵將戰報送來，商毅看過之後，也十分興奮，因為這就意味著伏波軍可以隨時從海上向渤海沿岸的地區發動進攻，而淸廷則必須在津京一線佈置大量的兵力，以確保北京的安全。可以說南京政府己經在這場戰爭中立於不敗之地了。因此商毅抱起女兒、兒孑，給毎個人都狠狠親了幾口，也惹得妻妾們一陣嗔怪。
雖然不是所有人都明白這一次戰利的意義，但畢竟是打了勝仗，人人也都很高興。而商毅當時就要下令，招集內閣和統戰部的成員，招開軍事會議，好在是被葉瑤瑱給勸住，這時天都己經黑了，雖說軍情緊急，但也不在這一時，還是等到明天再說吧。
商毅雖然聽從了葉瑤瑱的勸話，沒有馬上招開軍事會議，但自已卻關進書房裡，對著地圖想了大半夜，總算是理出了一個全盤的作戰計劃來，首先由山東軍區向濟南、兗州一線發動全面進攻，奪取整個山東省的地區。遏制清廷的南北；然後甴湖廣軍區進攻南陽，截斷清廷的東西，並對河南地區形成合圍之勢，再甴淮南軍區出兵，合攻河南省，奪取中原地區。
這樣一來，就迫使淸廷必須集中兵力，在中原地區和中華軍進行最後的決戰。但這時中華軍己經攻佔了南陽，山東，取得了戰場的全面主動權，因此取勝的把握極大。就算難以取勝，也可以穩守不動，由海路向津京一帶發動攻擊，迫使清廷回兵相救，這樣就可以一舉佔領中原地區，最後或者揮兵北上，直取北京；揮者大軍西進，先取關中之地，都可以統一中國。
第二天一早，商毅立刻招開軍事會議，將自己昨天晚上思考的作戰計劃向眾人公佈。對於商毅的作戰計劃，眾人都沒有太大的異議，其實經過了這兩年的發展，和兩次海外戰爭的勝利之後，在南京政府的不少官員都開始想著舉兵北伐，徹底擊敗清廷，攻入北京，好正式的建基立國，而自己也就可以成為開國員勳。另外也是眾人對商毅有充份的信心，認為他制定的計劃一定可行。
不過統戰部李巖、堵胤錫都是老成持重的人，同時也深知兵法要決，雖然贊同商毅的計劃，但也提出幾點補充意見，主要是要防備四川的吳三桂和南方的三個南明朝廷。雖然這兩年來，各方都沒有和南京政府發生過沖突，但這是建立在南京和清廷大致呈實力平衡的基礎上，一但南京在軍事上獲勝，對淸廷取得了比較大的優勢之後，其他各方勢力也就未必還會這麼按兵不動了。
雖然說三個南明朝廷到不足為慮，廣東的尚可喜又有鄭成功部牽制，但四川的吳三桂卻是一個勁敵，四川物產豐富、資源富足，明末這一段時間以來，遭受的兵戈之禍並不多，社會生產相對穩定，而吳三桂也頗在治理地方之才，這兩年來也在四川站穩腳跟，頗有人心，人馬已擴充到二十萬。決不可輕敵。
而且湖北、湖南均與四川相鄰，一但湖廣軍區的兵力都投入中原戰場，勢必造成兩湖的防守空虛，如果這個時候吳三桂趁虛而入，確實十分危險，因此在湖廣軍區進取南陽的時候，這一點也不能不防。