但這一來卻有一些人開始借題發揮，在華人中間散佈謠言，有人說中華軍根本就不是干係臘人的對手，以前打了幾個勝仗，不過是趁著干係臘人沒有防備，現在干係臘人動真格了，中華軍跟本就不敢去打幹系臘人了；也有人說中華軍己經快不行，跟著中華軍，大家早晚都要餓死，還是要另想辦法；還有人說這次屠殺根本就是中華軍引起來的，干係臘人本來就沒想過要殺華人，只是中華軍要來搶佔馬尼拉，干係臘人害怕華人和中華軍勾結，才動了殺心，只有把中華軍趕走，華人和干係臘人也就可以和平的在馬尼拉相處。
甚致還有少數人鼓動華人，應該去向干係臘人投降，幫助干係臘人趕走中華軍，這樣大家就都好過了。
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而軍隊的問題還只是一個方面，隨著戰火蔓延到了比農多區，雖然西班牙人的注意力全部放在和中華軍的戰鬥中，並沒有對比農多區的華人再進行大規模的屠殺行為，相反還對華人進行了一些安撫，但在這裡定居的華人也仍然感覺到了巨大危脅，在剛剛經歷了巴里安區的大屠殺之後，誰還敢再相信西班牙人的鬼話，包括傳教士的說教，也起不了任何的作用。品書網
因為華人對天主教的信仰確實並不虔誠，大多數華人只是為了溶入馬尼拉的生活，才不得不加入天主教的行列，當然華人對宗教也有相當大的包容性，往往都會同時信仰好幾種宗教，因此加入天主教，也並不覺得有什麼不妥，但在感覺到天主教的欺騙之後，有不少人在心裡都己經放棄了天主教，包括一部份曾經是很忠誠的教徒。
而中華軍抵達了馬尼拉之後，連繼打了好幾場漂亮的勝仗，也使許多以前對中華軍的戰鬥力信心不足的華人增加了不少的信心，因此也都紛紛撤移到南京商館來，尋救保護，包括許多在先前就躲進深山或是其他地區的華人，也都投到了商館來，也都結果在短短的幾天時間裡，又增加了四五千的華人。
現在商館己經爆滿，當然就住不下這麼多華人，因此宋協昌和張庚秋父孑幾人商議，將商館的周邊地區也都納入進來，做為華人的臨時避難場所。
但地區擴大之後，要防守的面積也就相當擴大，因此防守的任務壓力也加大了不少。宋協昌和房箴、韋章裕經過了一番商議，在避難地區的外圍設立五個防守據點，毎個據點安排一個連守衛，剩下的三個連作為總預備隊，那裡出現危險，就向那裡増援。另外民兵的數量也擴大到一千二百人，主要是維持避難地區的治安，另外在必要的時候，也將參與戰鬥。
不過這樣一來，中華軍也沒有足夠的兵力對修道院發動進攻,因此宋協昌也不得不放棄這個計劃，一心一意的守住現有的避難地區，等待著商毅的大軍抵達馬尼拉。
結果雙方又都停下了軍事行動，暫時以德爾×蒙塔修道院和南京商館為核心，互相對持起來。不過雙方在暗地裡，都在拼力的準備，等待著發動進攻的最佳時刻。
而在隨後的幾天時間裡，幾乎毎天都有大批的華人投靠到避難地區來尋求保護，也使中華軍保護下的華人數量進一步擴大，達到一萬五千多人，而且還不見減少。避難地區的範圍也只再度擴大，而為了有效保護避難地區，宋協昌只仔再増加一個據守戰。但這樣一來戰線也拉得更長，而機動兵力也進一步減少。
另外在一開始，還有一些華人帶著糧食物資逃到這裡來避難，但到了後來，逃過來的華人幾乎都是雙手空空，但到了避難區，中華軍還是管他們的吃喝，結果華人越聚越多，消耗的糧食為越來越大，本來還算是比較充足的糧食，又緊張了起來。
經過宋協昌、張庚秋等人對逃過來的華人詢問之後才發覺，到了後期，絕大部份華人都是被西班牙人或者是土著給逼到避難區來，他們對華人不再進行大規模的屠殺，而是將華人從居住地裡驅趕出來，不帶任何物資，逼著他們投奔了避難所來，其中有不少人都是來自十分避遠的地區。
宋協昌也意識到，這是西班牙人的詭計，加大避難區裡的負擔。雖然宋協昌也考慮過，再打劫幾個農場莊園，取得一些糧食物資，但在前一階段，商館周邊的農場莊園基本都被中華軍洗劫一空了，如果再想打劫，就必須到更遠的地區，至少需要一二天的路程。
同時宋協昌等人也從逃來的華人那裡瞭解到，西班牙人也在四處調兵，增加實力，現在己經聚集了大約三四千土著兵，另外還在向其他的海島調集兵力。還有多名我會，方濟各會的傳教士，也都在積集的活動，幫助西班牙軍說服其他的土著部落，出兵相助。
得知敵方的兵力己經得到了擴大，宋協昌就更不敢在輕舉妄動，因為一但出兵去搶劫其他的農場莊園，勢必靠成避難區的守衛進一步薄弱，一但西班牙軍乘虛進攻，後果將十分危險。而且就算打劫成功，在迴歸的半路上，也容易遭遇到西班牙軍的襲擊。
宋協昌也曾償試過派遣一支從一個排為核，輔以六百多名民軍，出去打劫農場，但民軍都是剛剛組建，也沒有經過任何的訓練，根著中華軍一起出戰，打打醬油還不覺得有什麼不好，而一但單獨作戰，就顯出極大的不足，六百名民兵進攻一個只有一百多名農奴守衛的農場，竟然整整攻打了一天，還是沒有攻下來，有兩次中華軍都己經開啟了突破口，己經殺進農場裡的民兵，居然還被農奴給打了出來，反而還損失了五六十人。
結果西班牙軍得知以後立刻發來了援軍，幸好是撤離得及時，才沒有遭受更重大的損失，但從那以後，宋協昌也不敢再派遣民兵單獨出戰了。
而一轉眼就過去了差不多半個月，又沒有糧食來源，眼看著人口越來越多，存糧越來越少，己經不足十天的供應了，而也不見援軍的訊息，宋協昌也十分焦急，有人甚致建議，放棄一部分華人，以減少糧食的消耗，也有人認為乾脆集中力量去進攻德爾×蒙塔修道院將西班牙人的勢力趕出比農多區。
在此其間宋協昌等人只收到了一封商毅的來信，說明現在南京發生事故，大軍會遲緩一段時間來到馬尼拉，不過商毅也給他們安排了另外一支援軍，很快就能到達馬尼拉，希望他們能夠克服困難，堅守到底。