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清軍的火船將商家軍的先鋒船隊衝亂之後，繼續順著江水，向商家軍後面的三支艦隊逼進了過去。品書網
清軍一共出動了五十多組連環船，己經點燃的超過了四十組，而先鋒艦隊的大部份戰船都被清軍的火船撞上，蔓延上了火焰，燃燒起來，只有四五條船依靠著出色的操船技術，加上一點運氣，才避開了火船的襲擊。而且就這樣，還有一曖驅逐艦和一艘護衛船因為躲避火船，結果在靠近江灘邊的地方擱淺了。
而這火船撞上的其他戰船中，有一部份雖然蔓延上火勢，但卻及時擺脫了火船，一面向安全的地方撤離，一面撲打著船上的大火。但至少有十餘艘戰船或者因為被火船纏住，或者因為火勢太大，而無法撲救，同時因為火勢一直蔓延到甲板下，火藥倉裡，引發了一連串大爆炸，船上倖存計程車兵也只能棄船跳江逃亡。
不過有一些火船在燃燒之後，鐵鎖斷裂，分散開來，也有一部份火船遭到商家軍戰船的近距離炮擊，或者是受爆爛的衝擊，被打得散了架，但因為都是木質結果，因此還能夠一邊燃燒著一邊在江面上飄浮，並且順著江流，向下遊飄流。不少火船衝過了先鋒艦隊之後，立刻就順著江流，直奔後面的船隊而去。
商家軍後面的三支船隊和先鋒船隊的距離並不遠，幾乎沒有多少時間做出反擊，就和火船迎頭相遇。面對著這樣大面積大範圍的火船進攻，除了躲閃和撤退之後，基本上沒有別的辦法，因為火船並不害怕受到攻擊。如果是在大海上，還可以利用海面的無限寬度，充分散開，以躲避火船，但在長江裡，迴旋的空間實在有限。因此在這種情況下，黃震也只能下令，各船暫時撤退，先躲開火船再說。
而在商家軍的後隊中，只有少數前列的戰船因為沒有轉向的時間，只能迎著火船而上，在火船陣裡來回的穿稜變向躲閃，再來慢慢尋找轉向的時機，而後面的絕大多數多戰船都立刻選擇了調頭、撤退。
但也不是每一艘船都能選擇好轉向的時機，或者說也不容他們有充足的時機來從容轉向，有時候只能冒一冒險了，因此在調頭的過程中，又有不少戰船被火船撞上，纏住，結果被火勢蔓延燃燒了起來。就連黃震乘坐的旗艦天權號，也在轉向的時候，被火船撞了兩下。好在是天權號的體形龐大，而且撞上天權號的，並不是連環船，才極時擺脫，沒有被火船纏住。終於調轉過頭來，向下遊退去。
而在江面上幾乎佈滿了燃燒著得戰船，殘骸、以及碎裂的板塊，燒燋了的，還在冒著濃厚的煙霧，星星點點，不計其數。還有無數棄船跳江計程車兵，在洶湧的江水中奮力掙扎著。
幸好是天威號向清軍的後續船隊發動的衝鋒，以一己之力，把清軍後續的百餘戰船攪得一團混亂，在無意之間，延緩清軍後續船隊跟進上來的速度，也為商家軍的其他穿突過火船攻擊的其他戰船贏得一線寶貴的時間。
在天威號從清軍的後續船隊中殺了出來，開始向下遊撤退的過程中，有十佘艘商家軍的其他戰船都穿過了火船，正在準備調頭回撤。而何濱也立刻下令，向他們打出旗語，把這些戰船都聚隴過來，組成好編隊，大家一齊掩護撤退。因為天威號是長江艦隊中僅有的兩艘巡洋艦之一，在另一艘巡洋艦天權號己經撤離的情況下，其他的戰船自然都是以天威號為核心。
而且在艦隊撤退的過程中，還救起許多落水救生計程車兵。只是有幾艘在江灘也擱淺的戰船，現在也沒空把它們都拉回到江中，何濱也只得下令讓這些戰船上計程車兵棄船，乘坐救生船逃離。靠近江北岸的，可以先上岸躲避，因為北岸是揚州府，這是商家軍的地盤，但長江南岸是鎮江府，因此靠南計程車兵只能盡力向大船靠隴過來，跟著大船一起撤退。不過在棄船的時候，有幾艘船上計程車兵還是點燃了火藥庫，將空船炸燬。
等清軍的戰船重新整好了隊形之後，商家軍的戰船，連同火船早己經跑遠了。因為這時商家軍的戰船也是順水，清軍很難追上。而且火船現在也都燒得差不多了，再追下去，就進入了商家軍控制的長江段，如果商家軍再回頭進攻，恐怕也不好對付，因此洪承疇也沒有下令追趕。
不過剛才商家軍一艘戰船就把清軍一百多艘戰船攪了一個天翻地覆，清軍都覺得臉上無光，因此也都有些提不起精神來。而洪承疇也都看在眼裡，也從座椅上站了起來，笑道：“各位看見沒有，商家軍的水軍己經被我們打敗了，逃走了，我們已經獲勝了。”
他身邊的一個家人洪保十分機靈，立刻接話道：“大帥南下第一戰，就大敗商家軍的水師，可喜可賀，此番南下督軍，進取浙江，掃平南方，也是指曰可待了。”
洪保這麼一說，洪承疇身邊的水軍統領劉夢蛟也趕忙道：“大帥神機秒算，大破商家軍的水師，我等都佩服之極。”