就是浙江銀行杭州總行剛剛掛牌成立，有訊息傳來，說是南京朝廷派遣黃宗羲為使，來到杭州，頒發對商家軍在山東取得的勝利的嘉獎詔書
商毅也不禁吃了一驚，這到不是說他沒想到南京朝廷會對自己進行表彰獎勵，立了這樣大的功勞，而且弄得風聲水響，怎麼樣也要給點獎勵但這次使臣的人選：黃宗羲到讓商毅有些意外
黃宗羲的大名，商毅當然是知道的，他是國古代著名的思想家、經學家、史學家和王夫之、顧炎武並稱為明末三大宗師學者是這三大宗師學者年紀最大，而且也是唯一一個有著深厚東林背景的人
不過在南明的南京朝廷時代，黃宗義的表現和其他東林黨人並沒有什麼區別，視野狹礙，思想頑固，觀念偏激，但卻偏偏又自以為清高道徳，自以為事，眼高手低，不僅沒有為南明朝廷做多少實質有用的工作，而且只顧內鬥，不顧大局，使南明的力量在內耗不斷削弱而在這方面，黃宗羲也可以算是東林黨的一個典型代表人物甚致可以說南明南京朝廷的短命，包括黃宗羲在內的東林黨也有不可推缷的責任
而且在南明滅亡之後，有一些學者也在反思東林黨的行為，只有黃宗羲依然全力在為東林黨辯護，他的觀點是東林黨都是正人君，凡事與東林黨作對，或意見不同，就是奸佞小人而後世的學者往往出自對黃宗羲在學術思想上成就的尊重之情，只好對黃宗羲在這段時期的表現和政治觀點避而不談，有意忽略
不過儘管黃宗羲在政治上的表現差強人意，甚致可以說是十分拙劣，但商毅也不否認，黃宗羲在思想、學術上的成就，確實達到國古代最高境界，被稱為宗師絕對一點也不過份畢竟是人無完人，一個優秀的思想未必就是一個高明的政治家這種顯像也並不少見，在另一時空裡的二百多年以後的那位康聖人，同樣在思想成就上獨樹一幟，但在政治上的表現幼稚得連兒童都不如；還有比康聖人稍晚些時候的孫國父，雖然無愧於民主革命的先驅者，但在政治領域，同樣也是被晚清的老官僚們玩弄於股掌之間
黃宗羲的政治理想主要集在《明夷待訪錄》一書，在國古代，敢於罵皇帝不少，最知名的莫過於海瑞的那一份第下第一疏而黃宗羲的最大成就就在於，他並非把予頭對準歷史上的某一位皇帝，而是從民本的立場來抨擊整個君主制度
有學者認為黃宗羲的思想仍屬治權在君，並沒有到達近代民主思想的標準，也有學者認為黃宗羲的思想是近代民主思想，在民權理論上還越了歐洲的盧梭但無論是那一點，在國己經維持了數千年的君主制度社會，能夠提出“天下為主，君為客”的觀念來，也是極其難能可貴的
商毅在南京的時候，和黃宗羲到是見過一面，但兩人並沒有什麼交流黃宗羲只把商毅當做一般的武將存在，而商毅也不想和東林黨多拉上關係
商毅兩次上報到南京的山東捷報，給南京朝廷造成了不小麻煩，因為現在南明朝廷，無論是東林黨還是馬黨都己經取得了一致的意見，決意與淸軍議和因此以馬士英為首的一批官員但心商毅的行動會激怒清軍，而拒絕與南京朝廷和談而吳甡卻認為商家軍在山東取得的勝利，可以讓清軍認識到南京朝廷還是有相當的實力，不可輕易戰勝，對議和是有幫助的
雖然兩派的觀點各異，但不管怎麼說，商家軍畢競是取得勝利，而且還是對清軍的勝利，當然應該給予嘉獎不過商毅的官職爵位己經夠高了，這一次也就只賞賜，不加級，但對在山東戰場的幾員商家軍主將都給予加官晉爵周少桓現在己經是副將，加授山東指揮使，童大勇現在是參將，加授山東指揮同知等等而黃宗羲就是被派來宣告南京朝廷的封賞同時還有封周世奇為浙江布政使、王夫之為浙江按察使的正式公
當然黃宗義還有一個使命，就是勸商毅著一點，別幹得太過火了，萬一真把清軍給惹急了，也不好辦因為黃宗羲也也同意與清軍暫時議和
和左良玉、江北四鎮這些軍閥不同，在表面上，商毅對南京朝廷還是表現得相當尊敬黃宗羲的官職並不高，但是朝廷的特使，也就相當於欽差大臣，而且又是著名的思想家，因此商毅也對黃宗羲做了十分隆重的歡迎並且帶著周世奇和王夫之在杭州城外迎接
雙方見面之後，商毅也主動上前施禮，笑道：“南雷先生，南京一別近兩個月了，別來無恙嗎？”黃宗羲在晚年號梨洲，但在年輕時號南雷，因此商毅也這樣稱呼他，以顯得對他尊敬
見商毅的態度客氣，黃宗羲也不能據敖，他對商毅雖然不怎麼待見，但也清楚現在東林的首要敵人是馬士英，而商毅從一定意義上說，還可以算是東林黨的盟友，因此拱手施禮，道：“商軍門，久違了”因為商毅是以武將出任巡撫，因此按慣例可以被尊稱為軍門
兩人都客氣了一番，然後商毅又向黃宗羲指引周世奇和王夫之其實王夫之對黃宗羲也慕名己久，因為這個時候黃宗羲的章學識在仕林己經很有名氣了