清軍雖然是徹底退走了，但善後的事情卻還有一大堆，就是濟南城裡的這些物資，雖然以經運走了一批，但留下來的卻是絕大多數，要全部運回穆陵關，也是一項大工程。因為濟南並不是商毅防區，一但等到朝廷派來官員接手，這些物資歸誰所有，還真不好說，畢竟這年頭日子都不好過，誰不眼饞白花花的銀子和糧食。因此還是要儘快運回穆陵關為好。
好在第二天，穆陵關派來的車隊也到達了濟南，大大小小一共二百多輛車，加上濟南城裡的牛馬驢等大牲口加起來也有兩萬多頭。士兵一萬八千多人，也是人多力量大，而牲口多力量就更大了，終於一次性把所有物資全部都搬完了。不過商毅還是留下楊武丞帶一千人守住濟南，一面招集流亡逃走的百姓回城定居，一面等待朝廷派官員來接收關城。
佈置好了這一些之後，商毅這才率領著大隊人馬，連同所有的大車小輛離開濟南，返回青州的穆陵關。
大軍行進沿途都能夠看見許多難民，有的三三兩兩，也有幾十人成群結隊，商毅派人一打聽，才知道他們多數都是本地的居民，因為躲避清軍，還進深山老林裡，現在聽說清軍以經撤走了，於是又都出來返回自己的家園。
商毅得知以後，心裡也不禁十分感嘆，兵荒馬亂的年月，受苦的永遠都是百姓。因此也讓人告訴這些百姓，濟南府以經被明軍收復，他們可以到濟南府去安居，重新開始組建家園。並且又送給他們一些糧食和銀兩。反正現在腰包豐厚，送出幾百石糧食，幾千兩白銀根本算不得什麼？
而得了錢糧的百姓自然是對商毅感激萬分，也有不少人願意跟隨商毅到穆陵關去定居，懇請商毅收留自己。商毅也沒有拒絕，讓他們跟在自己的隊伍後面一起走。
人馬一路東行，走了三四天，進入青州府境內，這時商毅收到了青州府的公文，原來登萊巡撫曾化龍以經到達了靑州府，請商毅到青州府去一趟。
雖然商毅很想馬上回到穆陵關，但上司來公文還是必須去應付的，因此將大隊人馬交給周少桓帶領，同時又囑咐他們一番回到穆陵關之後的事情安排。然後自己只帶了段鵬等十二名護衛人員，趕到青州府。
一天之後，商毅到達了青州府，在城門正好遇到兩位認識的官員，韓志和肖文軍，他們是奉了曾化龍的命令，來迎接商毅進城的。
熟人相見，自然是一番寒宣，而且這一回商毅又立了一次大功，淸軍又退兵回去，商毅升官也是指曰可待，兩人都算不清楚，商毅應該升到什麼官了，參將、副將、總兵，都有可能。因此也對商毅顯得十分熱情。
於是商毅就在兩人的陪同下，來到了青州的知府衙門。這時登萊巡撫曾化龍，青州知府孟宏恭為首的一干登萊青州地區的三十餘名文武眾官員們都以經匯聚一堂，等待著商毅的到來。
進了府衙之後，商毅首先向曾化龍行禮，道：“穆陵關千總司千總商毅，參見巡撫大人。”
曾化龍親自下座，把商毅扶起來，呵呵笑道：“商毅，不必多禮了，你這一次可以立下了不少大功，本官以經如實向朝廷上奏，相信很快朝廷就會有旨意下來，到那時你可就不在是一個小小的千總了。”
商毅忙道：“這些許小功，全是巡撫大人指揮有方，三軍將士齊力協心殺敵，卑職不敢自居其功。”一指孟宏恭，道：“特別是孟知府，這次收復濟南府，也幸虧有孟知府的大力協助，支援了不少物資不說，還調動了兩千人馬。”
孟宏恭聽了，心裡也大為放心，他生怕商毅在曾化龍面前說出青州兵在濟南府中犯下的劣績，好在商毅不但沒有說，相反還有曾化龍面前直言，收復濟南府是得到自己的物資人馬協助，這樣一來，自己也能佔一份功勞。因此對商毅也十分感激，忙道：“那裡那裡，收復濟南還是商千總出力最大，我們青州府只能提供這些小小幫助了，說來實在是慚愧。”
接著曾化龍又一一向商毅指引了其他官員，這裡面一多半商毅都不認識，但也有幾個熟人，如膠州守備劉天錫、威海衛指揮馬漢福，大嵩衛指揮高天，尋山後所千戶楊明遠和王徐寨前所千戶馮志剛等人，而在見禮的時候，這幾個人也對商毅表現的十分親近，拍肩搭背，以顯示自己和商毅是老交情相識了。
而其他的官員見商毅不過是一個小小的千總，卻如此受巡撫曾化龍的賞識，而且眼看著就要升官，這次升官還一定不會小，也不禁都看著商毅，目光中又羨又嫉。