溫克圖看了看身邊潰敗回來計程車兵，又看了看正在向自己逼近過來的穆陵軍，終於明白，這一仗是徹底失敗了。如果等穆陵軍逼近過來，進入火槍的射程之內，自已恐怕也難以逃脫，因此也只得拔轉馬頭，隨著人潮一起敗退了下去。
而這時進攻左翼的蒙古軍本來就是在免強應付，一見中路的人馬敗了，那裡還敢再繼續支撐下去，也立刻就跟中路一起敗退了。而進攻右翼的淸軍雖然還十分頑強，依然和穆陵軍殺得難分難解。但中路和左路的人馬全都敗退之後，這一路的清軍再算頑強也是孤掌難鳴，因此只能也敗退了下去。
就這樣淸軍終於全線潰敗,四散逃開了。
就在這時，商毅也接到了在濟南府裡，被俘的百姓在趙從夫、吳漢生等人的組織下，成功的發動了暴動，以經打敗了留守的清軍，佔領了濟南府全城的訊息。一見淸軍全線潰敗，也立刻下令，令穆陵軍趁勝追擊。同時命令留守在歷城縣裡的兩千青州府人馬，讓他們先期趕到濟南府，去接收關城。
如果溫克圖沒有收到濟南府城中發生動亂的訊息，他自然就會向濟南府裡敗退。但現在溫克圖也明知道，濟南府恐怕是守不住了，逃到濟南府也是死路一條，因此也只能放棄濟南，率領一部份人馬，向西落荒敗走。好在這時穆陵軍也忙著接收濟南府，也並沒有苦追，只追擊了一會兒之後，就收兵返回濟南去了。
而清軍一氣跑出了二十餘里，一直退到了齊河縣附近，才算停住了腳步。這時溫克圖這才收隴殘兵敗將，並又派人到各處去招集其他的敗兵，順便還打聽一下明軍的動向。
在一天之後，終於聚隴了差不多有三千多人，同時也知道，濟南府確實以經被明軍攻佔了。並且從幾個濟南城裡逃出的清軍口中得知了濟南府內發生動亂的一些詳細情況。
現在濟南府是徹底丟了，而且以溫克圖目前的這一點兵力，想要復奪濟南府等於是痴人說夢。但如果就這麼到兗州府去見阿巴泰，溫克圖也知道，那肯定也是死路一條，非被阿巴泰殺了警告全軍不可。但想要逃走，自已的家人卻還都留在關外。因此溫克圖思來想去，最後終於決定，趁著阿巴泰還不知道濟南丟了，冒險潛回關外，把家人接走，然後再遠走高飛。於是就在當天夜裡，溫克圖帶著幾個親信，收拾了一些金銀細軟之物，又牽了十餘匹馬，連夜向北而去。
而第二天一早，其他的敗兵忽然發現，自己的甲喇額真不見了，也都各自亂了起來，又等了一天，也不見溫克圖回來，也就都知道，他大概是跑了。於是也有人趁亂跑掉，不過大多數人還是決定，到兗州去向阿巴泰報信。但這麼一耽擱，等阿巴泰收到濟南失守的訊息時，以經是十餘天以後的事情了。
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打敗了清軍之後，商毅留下一部份人馬打掃戰場，帶著另一部份人馬也來到了濟南，並且馬上命人騎快馬分別像青州府和登州府報捷。
但就在剛一進城的時候，又發生了一件商毅意想不到的事情。
原來清軍在濟南府中屯集了大量糧草物資，僅白銀就有好幾十萬兩、堆了好幾間庫房。趙從夫和吳漢生帶領著百姓打跑了留守的清軍之後，百姓們只顧殺清兵，搶食物，也還沒顧得上其他，加上兩人又對百姓加以安撫，因此城中還保持著比較好的秩序。
但就在兩千青州兵進城之後，情況立刻就全變了。
這批青州兵別看打仗沒有能耐，但幹別的卻是一套一套，進城一看，清軍都跑光了，除了自己以外，再也沒有別的人馬，致於那些百姓，他們還沒放在心上。立刻就大膽了起來，分頭在城裡大肆搜找起來，清軍屯集的物資本來也沒有刻意隱藏，因此被他們毫不費力就找到了不少，一看城裡原來有這麼多好東西，那還客氣什麼，立刻就開搶起來。
一開始他們只是搶東西，但很快就有一部份青州兵把目光放到百姓們身上，說不定這群百姓身上還藏著不少好東西呢？同時還有被清軍選出來的數千婦女，都在各自尋找親人，雖然男女混雜，但也看得出女人不少。於是青州兵們也都動了壞心思，藉口搜查，開始對百姓們吆五喝六，打罵申訴，拉拉扯扯起來。
如果是在平時，老百姓到也只能忍受，但這時百姓們剛剛打退了清軍，身上的熱血還沒有平息下來，那些忍得了這個，雙方立刻就發生了衝突，並且很快就打了起來。不過明軍的戰鬥力和清兵相比，實在是差得太遠了，因此被百姓們打得東倒西歪。這部份青州兵一見打不過百姓們，趕緊去找其他人來幫忙，而百姓們同樣也有幫手，雙方越聚越多，仗也越打越大。以經發展到了二三千人的混戰。
而趙從夫、吳漢生等人只有幾十人，濟南這麼大，根本就管不過來，等他們接到訊息，趕到衝突現場的時候，雙方以經打得不可開交了，不是他們這幾十個人能拉得開的。幸好這時商毅以經帶領著穆陵軍進城，聞迅之後，也立刻趕到了現場。