吳昌時是在吏部衙門公房被錦衣衛直接帶走的，當著吏部一眾官吏的面。緊接著，吳昌時京中的宅第也被查封。
吳昌時被錦衣衛抓走後，立即被關入了北鎮撫司詔獄之中。
周延儒聽到這個訊息後，立即慌神了。他親自過問此案，可錦衣衛指揮使劉僑絲毫不給他面子。
劉僑親自坐鎮詔獄審訊吳昌時，僅半天，吳昌時就熬不過錦衣衛的刑具，全盤供認，在罪狀上畫押簽字。
劉僑將供狀呈交皇帝與總理處，吳昌時大小罪狀數十條，其中最重要的罪狀則有四條，一是能內，也就是結交內侍。而按明制，交結內侍者斬。其二，吳昌時大肆貪汙，收受賄賂、賣官。其三，毒殺張溥，其四，勾結首輔周延儒、煽動京軍鬧餉，謀逆做亂。
這四條大罪之餘，還有許多條罪狀。
但僅這四條，每一條都夠吳昌時死一次了。
朱慈烺看過之後，立即召劉鈞、劉宗周、吳甡入見，出示供詞，然後令他們召集都察院、大理寺、刑部三司會審，東廠和錦衣衛協助偵輯，嚴查周延儒的涉案之事。
“陛下，三司會審，廠衛協查，已經取得確切證據，首輔周延儒確實是京軍鬧餉幕後之主謀，其貪汙等事，也一一查明，都是屬實。據查，周延儒僅復出任吏部尚書後到如今，短短兩年時間，就已經貪汙贓銀累計一百三十餘萬塊銀元之多......”
朱慈烺年紀雖輕，可也十三歲了，對於向來信任的首輔周延儒如此之事，氣憤萬分，將狀子向御案上用力一摔，狀子掉到地上，他還上去用腳猛跺，咬牙切齒的說道，“先帝如此信賴他，兩度任用他為首輔，臨終還以他為顧命大臣，卻不料，此人品性敗壞如此，短短兩年，居然貪汙一百三十多萬塊銀元，簡直是國之蛀蟲。劉僑！”
劉僑跪下。
“立即去把周延儒帶來，朕要當面詢問，看他做何解釋！”
“是，臣遵旨。”
劉僑轉身離開，出去的時候從劉鈞身邊擦身而過，兩人目光隱秘的交流。
周府。
周延儒自早上起一直坐在書房裡，整個人臉色蒼白如紙。今天早上，周府就已經被錦衣衛給圍起來了，一個人也出不去，一個人也進不來。連個買菜的奴僕都出不去，周延儒出門上朝，也被攔住了。
周延儒當時就有種天塌下來的感覺，他知道，這次他出事了。
吳昌時出事的第一時間，他就擔心事情最終會燒到他身上來，現在果不其然，事情最終燒上身了。
老管家慌忙的跑進來。
“大人，錦衣衛闖進來了。”
管家的話未落，錦衣衛已經踢開了書房的門。周延儒轉頭，“劉僑！”
劉僑掃視了一遍書房，然後對身邊的錦衣衛使了個眼色，頓時幾名校尉上前將管家推了出去，並把書房門關了起來。
“周先生，陛下有旨。”
周延儒忙站起身來，整理下衣服。
“不必擺香案了，就在這裡聽旨。”劉僑道。
周延儒跪下接旨，身體不可抑制的顫抖起來。
“皇上有旨，首輔周延儒多貪髒不法，甚失朕望，姑念其往日功勞，不約公開處置，著即令自縊，保其全屍。欽此！”