另一個方向，尹拉古克三呼圖克圖這系，屬於額爾德尼這系的，朱以海有意平衡格魯派，一直在扶高年紀大卻不怎麼參與政事同時實力要弱的班單系。
尹拉古克三呼圖克圖就是在朱以海的旨意下，被班單正式認證為呼圖克圖。
朱以海之前故意派金聖嘆見五世，提出說達賚汗想請他移去青海駐錫，嚇的五世緊張不安趕緊各種推辭，讓他很不安了一陣，然後過了一段時間，朱以海再讓金聖嘆找他，提出要不改安排新的尹拉古克三呼圖克圖去青海駐錫吧。
就跟漠南、漠西、漠北的咱雅、章嘉、哲布尊丹巴三大呼圖克圖一樣，以後青海這片，由尹拉古克三呼圖克圖統管。
朱以海故意先提出要掀房子，然後再說要不開個窗吧。
這一折騰，那位同齡的五世終究還是答應了，於是格魯派兩位領袖聯手認證，加上大明天子的金冊金印冊封，阿奴的兄長便成了青海區的金紫袈裟大和尚。
皇帝給他冊封的兩位格魯派首領，以及五位呼圖克圖各賜紫金袈裟。
其實皇帝有意透過冊封呼圖克圖，以加強對格魯派的滲透影響，甚至不僅是黃教，對其它教現在皇帝也一樣伸手，同樣冊封歸附親明的那些僧人呼圖克圖等高階頭銜。
還跟冊封蒙古貴族以汗王、濟農、諾顏、琿臺吉、五等臺吉一樣，也給這些各派和尚們，設立了一套職銜，分為呼圖克圖、諾門罕、班第達、堪布、綽爾濟等九等。
又還另有封號如*師、*師、禪師、*師等五等。
還有加給字樣，諸如輔國、闡化等。
這套東西跟給蒙古王公們的汗王臺吉、王公侯伯等是一樣的，將和尚們更加全面的納入規範統治中。
尤其是對格魯派管理要更加嚴格。
現在就是一位法王教主，便是甘巴赤丹，格魯派祖寺的主持，五年一任，由兩位格魯派領袖共同推舉，皇帝稽核任命，這是名義上的教宗。
實際則是由班單和達賚兩大領袖總領格魯派，甚至是整個藏地宗叫事務，他們分管前後藏。
接著便是由朱以海親自冊封的五大呼圖克圖了。
章嘉統漠南，哲布尊丹巴管漠北，溫薩統漠西，尹拉古克三管青海，而原管漠西的咱雅轉去康區。
至於阿里地區，朱以海之前已經冊封前來朝拜的竹巴噶舉派的達倉熱巴為呼圖克圖了。
其實本來藏地各派的活*系很多，就算格魯派自己都很多，但現在朱以海有意整合，加以控制。
六大呼圖克圖，實際就分統了現在的幾大片區，互不統屬。
特別是他規定，不能再跟以前一樣直接指認轉世了，必須得是在呼圖克圖圓寂之後，由朝廷、甘丹赤巴一起派人去尋訪侯選靈童，建議訪十二侯選，最終透過金瓶摯籤的方式選出新的呼圖克圖，並經由兩大領袖認證，以及大明天子的冊封，新的呼圖克圖必須到北京面聖，親自接受正式冊封后才是正式的呼圖克圖。
不僅六大呼圖克圖得按照這套金瓶摯籤的程式選出，而且其它小呼圖克圖系，也一樣不得指認，必須選認。
除班單兩位領袖是在喇薩金瓶摯籤選任外，其餘的大小呼圖克圖，必須都得在北京摯籤，並且規定了在現有的呼圖克圖外，不得再隨意增加呼圖克圖稱號了，要新增必須得報請北京批准。
清朝的時候，全蒙藏的呼圖克圖，多達一百五十八名之多，都有自己的轉世體系，
清代北京還常駐八位呼圖克圖。
在朱以海的這套管理改革規劃裡，主要還是要劃區管理，六大呼圖克圖加班單兩人，實際就是八大片區，分而治之。