“澳門已經清理整頓完成，進駐兩營人馬，香山縣丞也移駐澳門並開衙長駐，另廣州市舶司也在澳門設澳門海關。”
“島上葡萄牙人，也都全部普查登記，符合要求的發放居住許可證，共發放九百一十三張，另有十七人查犯了海上劫掠，在沿岸搶掠偷盜、販賣人口等罪，已經逮捕審訊，定罪後押往廣州監獄關押。”
“還有四百七十餘人是葡萄牙人娶大明女子所生混血，對這些人，按最新律法，父母皆夷則為夷，父母一方為夏，則為夏。所以給予他們入大明戶籍。”
“其餘在島上的黑奴、南洋奴等上萬，他們原為葡萄牙人私產，但根據我大明律令，禁止在華夷人蓄奴，所以他們都被劃入皇家少府監下僱傭長工，給予臨時居住證和工作證。”
“另葡萄牙人與倭人、南洋人夷人所生混血，按規定也皆為夷，登記後仍發給居住許可證。”
廣東巡按張煌言向皇帝當面奏報澳門事務。
在朱成功的水師包圍之下，在皇帝的強硬態度下，澳門的總督、大法官、市議會等都慫了，他們沒有半點對抗的力量。
而得到大明皇帝承諾以後可以繼續居住澳門，還可以繼續通商貿易後，他們最終只得投降。
不投降也不行，這些年葡萄牙人早已衰弱，他們在印度在錫蘭在馬六甲，一路敗退，一個個殖民據點被英國人、荷蘭人攻佔，許多殖民據點的葡萄牙人甚至被屠殺。
澳門的葡萄牙人雖不多，但許多人已經是數代定居了，他們與本土的葡萄牙人已經很不一樣了，雖然說經過他們的爭取，葡萄牙國王也下令，承認在那些殖民地出生的葡萄牙子女，也一樣是葡萄牙人。
但澳門畢竟只是一個遙遠的據點，尤其是在失去了馬六甲後，這裡是個孤懸於外的據點，他們也無力來保護這裡。
能夠留下來，總比被攻佔趕走甚至屠殺強。
雖然葡萄牙人對於大明天子提出的這些條件很不滿，尤其是他們在島上的房屋商鋪不動產的徵收，對他們蓄養奴隸的沒收，非常不滿，但這是他們留下來的必須條件之一。
其它諸如自治權、築堡擁兵、收稅、司法等權被奪走，那更不用說，沒半點條件可講。
張煌言親自上島處理。
朱成功帶著御營艦隊，攜收復臺灣大敗荷蘭人的威勢，直接上島，接收炮臺、城堡，每條街巷都派兵駐守，然後挨家挨戶的沒收他們的武器。
接著香山縣丞到澳門開衙駐守，衙門六房三班也配製齊全，胥吏們開展工作，編戶齊民。
葡萄牙人建的城堡，建的房屋，建的商鋪，全被沒收，給予適當補償。
他們的議會、法庭全部取消，總督也被送離澳門，乘船返回果阿。
澳門其實並沒有真正的軍隊，以往印度果阿總督府，每年會派一支商船隊過來，武裝商船隊有個司令，他到了澳門後，會在澳門呆上幾個月時間，等次年季風起再返航，這段時間也是貿易時間，他在澳門的這段時間，便成為澳門的最高軍政首領，他船上的兵自然也成了澳門的武裝力量。
不過因為澳門議會跟這個司令經常鬧衝突，所以近些年才正式派總督前來常任，這總督來了後也開始奪取行政大權，甚至組建了一支傭兵隊伍，甚至在發生戰鬥時，葡萄牙人也都有義務出戰協守。
現在明軍上去後，直接沒收武器，趕走總督，重新編戶齊民。