儘管她已經察覺蚩尤身上似乎並沒有妖魔之氣，但出於顏面和被打敗的失落感，讓她對蚩尤生出嫉妒之心，負氣之下她違心的向神靈撒了謊，說蚩尤化身妖魔，假以時日必定生靈塗炭，連她也不是其對手。
玄女一族一向處事公正，神靈自然不會想到玄姬會撒謊，特意賜下封妖鏈，助她斬妖除魔。
說到這裡，玄姬滿臉都是懊悔痛恨之色，承認她為了賭氣和炎帝皇帝聯手，用封妖鏈出其不意封印了蚩尤的神魂，黃帝才一擊得手將其斬殺。
可她怎麼都沒有想到在斬殺蚩尤後，炎帝和黃帝雖然按照承諾把石人交給她，實則卻包含禍心，轉身就向仙界告了玄姬一狀，說她覬覦蚩尤的修煉功法，擅自率領玄女族參與人間爭鬥，奪取巫族的功法。
神靈震怒，賜予黃帝神器流光，賜予炎帝九幽冥火，令其二人斬殺玄姬，並降罪玄女一族，參與戰爭者斬殺，未參與者也被剝奪了仙籍，修為無法寸進。
其實仙界也並不像人們所想像的那樣一片祥和，其中也是爭權奪勢，爾虞我詐，紛爭不斷。
九天玄女身為戰爭女神，在神魔之戰中屢立奇功，才爭取到讓她的族人牧守人間，享受人間煙火，早就引起諸神的嫉妒和不滿。
這一次被抓住了把柄，諸神對其群起而攻之，九天玄女遭到責罰，也無法再庇護其族群。
卻不料炎帝陽奉陰違，玄女一族明明只有玄姬一人出戰，他卻對整個族群大開殺戒，要將其斬盡殺絕，並霸佔了和仙界唯一的聯絡通道——通天祭壇。
石人確實被玄姬拿走，這讓她百口莫辯，這才醒悟中了炎帝和黃帝的詭計，他們有著稱霸天下的野心，卻不希望有玄女一族這樣的人間守護者騎在他們頭上，這才用一石二鳥之計出去九黎和玄女一族，但等她明白過來時悔之已晚。
玄女一族因此而遭遇到比九黎部落還要悽慘的命運，大部分都被殺死，只有少數見勢不妙而逃入蠻荒，曾經的守護者成為了人人喊打的過街老鼠，惶惶不可終日。
玄姬一失足成千古恨，看著族人因為自己一時負氣而家破人亡，顛沛流離，讓她成為滅族的罪魁禍首，懊悔自責不已。
但她不甘心就這樣成為陰謀中的犧牲品，也不甘心就這樣束手就縛，她死不足惜，但她不想連累整個族群，所以她要恢復玄女一族的昔日榮光來贖罪。
可想要達成這一目標談何容易，留給她的就只有一條路——成神。
強者為尊，無論是在仙界還是人間都是鐵律，她只有擁有足夠強大的力量，才能前往仙界，解釋清楚事情的來龍去脈，為玄女一族洗清冤屈。
玄姬躲入蠻荒，想要破解石人的秘密，這是她成神的唯一希望，可她沒有蚩尤血脈，根本無法破開石人的封印，這時候她才意識到蚩尤是何等的強大，假以時日，他必然會成為遠古之後第一位成就神位之人。
玄姬藏身蠻荒，過著茹毛飲血的原始人生活，潛心研究封妖鏈，畢竟封妖鏈是神級封印之術，和血脈封印有著異曲同工之妙。
功夫不負有心人，在東躲西藏的日子裡，玄姬終於學會了神級封印術，只可惜蚩尤的封印是以巫力加持，她就算掌握了神級封印術，也只能勉強破開部分封印，窺探到石人的部分秘密，卻根本沒有成神的可能。
但她也從破解石人中獲得了關鍵的資訊，蚩尤真正最核心的傳承藏在他的寢宮“巫神宮”當中，而石人，卻是開啟巫神宮的鑰匙。
於是，玄姬只能想辦法尋找“巫神宮”，企圖獲得核心傳承，從而絕地反擊，成就神位以洗刷冤屈。
卻不料在她剛剛找到“巫神宮”的線索時，卻被炎黃二帝發現蹤跡，聯手前來追殺，三人展開驚世大戰。