要想成為忍者，體內就必須要有查克拉。
而要想擁有查克拉，體內就必須要有查克拉種子。如果一個人的體內沒有查克拉種子，那麼這個人不論多麼努力，都不能夠在體內提取出一丁點的查克拉。
查克拉種子的作用，就是能夠將忍者體內的精神能量和身體能量完美融合成一種新的能量——查克拉。
而查克拉種子也不是憑空出現的，它來自於血脈的遺傳。
而查克拉種子的源頭，就是來自於六道仙人大筒木羽衣。
大筒木羽衣為了讓當時的人們能夠互相理解，互相包容，就將能夠連結心靈的力量——查克拉，分發給了信徒，從而建立了忍宗。
查克拉為什麼能夠連結人們彼此的心靈，讓人們互相理解，包容呢？
因為查克拉就是透過查克拉種子將身體能量和精神能量完美融合為一體的特殊能量。查克拉中擁有本人的精神能量，所以當人們放開自己的心靈後，就可以透過彼此的查克拉的連結來互相感受他人的心靈，想法，痛苦，快樂等情緒，經歷，思想。
大筒木羽衣正是認為這個世界上，只要多點理解，包容。能夠感受他人的痛苦，無奈，從而能夠約束自我，以此來達到減少戰鬥，戰爭，世界和平的目的。
正是為了實現這個目的，所以大筒木羽衣才將查克拉種子散發出去，讓信徒們都能夠擁有查克拉。
而大筒木羽衣體內的查克拉種子又是從何而來呢？
他體內的查克拉種子來自於他的母親，大筒木輝夜。
大筒木輝夜也不是一開始就擁有查克拉的，她是在吃掉了這個世界上的神樹果實，才擁有查克拉的。
也就是說，大筒木輝夜透過吃掉了神樹果實，從而擁有了查克拉。
然後，作為大筒木輝夜的兒子，大筒木羽衣自然的從血脈遺傳中得到了查克拉種子，從而擁有了查克拉。
然後，大筒木羽衣為了所謂的世界和平，讓人們不再產生戰爭，能夠互相理解。從而將查克拉種子分發給了信徒，建立了忍宗。
信徒們得到查克拉種子後，透過不斷的遺傳下去，就形成了後來也就是如今的忍者世界。
追溯查克拉的起源，可以發現，查克拉來自於查克拉種子，而查克拉種子的最初來源，是六道仙人大筒木羽衣。而大筒木羽衣體內的查克拉種子，來自於自己的母親，大筒木輝夜。
大筒木輝夜體內的查克拉，來源於這個世界的神樹果實——查克拉果實。
因為查克拉是由精神能量和身體能量完美融合的一種能量，所以，當大筒木羽衣將體內的查克拉種子分發出去的時候，其他得到查克拉種子的信徒們，也間接的得到了或多或少的大筒木羽衣的血脈基因。
查克拉種子主要靠的是血脈遺傳，所以千手一族和宇智波一族才是後來忍界中最強大的忍者家族。因為他們的查克拉種子是遺傳自大筒木羽衣的孩子，次子大筒木阿修羅和長子大筒木因陀羅。
而後來的漩渦一族和輝夜一族等其他忍者家族的祖先，或許是因為當時從六道仙人大筒木羽衣的查克拉種子中得到的血脈基因更多，所以就要比其他的忍者更加的強大。
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