而電子資料開始演化各種不同的生命體，是生命體就會遵行生命進化的規則。
而這些異於常人的生命體被稱為異種生命體，但他們不認為自己是異種生命體。
其中，異種生命體中的第一智者——古代賢者獸，查閱所有資料，發現數碼世界的誕生是因為與數碼世界很近的人類世界中的電子裝置演化出來的。
而異種生命體竟然是因為沒有絲毫力量的人類而誕生出來的。
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最後，異種生命體統稱數碼寶貝，直到數碼世界危機的誕生，數碼寶貝和數碼世界就此出現在人類眼中。之後，數碼寶貝又出現了幾個不同的名字，如數碼暴龍、數碼精靈、數碼獸之類的。
人類有一種神奇的力量能讓數碼寶貝快速進化。這種力量被稱為心靈之力。
人類本身複雜多變，美好面的心靈力量除了能讓數碼寶貝正常進化，但人類的負面能量卻是會讓數碼寶貝走上錯誤的進化道路，錯誤進化的數碼寶貝除了殺戮不在有其它想法，破壞周圍的一切，直到力量耗盡。
為了不讓數碼寶貝走入錯誤的進化道路，危害數碼世界和人類世界，所以選擇人群就集中到了心靈純淨的小孩子中。
由於人類與數碼寶貝不同種族，無法溝通，所以藉助神的力量集中的這些能讓數碼寶貝正確進化的正能量，特別製作了能讓數碼寶貝和人類溝通與進化的神聖計劃！
而這些正能量都是人類的正直面、美好面。
即勇敢、友情、愛心、純真、誠實、知識、希望、光明，還有一條特殊進化路線溫柔！
隨著數碼寶貝與人類的接觸，當有一天數碼寶貝和人類之間溝通沒有了障礙，更多的問題和危機接踵而來。
數碼世界的危機由人類出手結束，但新的危機又從人類這裡開始…
人類與數碼寶貝的過分接觸導致數碼世界與人類世界的空間壁變得薄弱，最後人類世界竟然與數碼世界開始融合。而融合的結局只有一個。
“兩個世界同時毀滅！”
而數碼世界的神最後的決定是毀滅人類世界，拯救數碼世界。
最後關頭，人類本身竟然又誕生出一種新的力量。數碼之魂！
藉助這種力量，人類世界與數碼世界安然度過難關。
但由於人類的這種不可預料與無法估計，比之原來的數碼世界更加危險，數碼世界的神決定永久關閉人類世界通往數碼世界的大門。
但關閉數碼世界與人類世界的大門就能解決問題嗎？
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