如今雙邊已經初步定下融合的基調，很多事情便也紛至沓來。首先便是除去大名舊勢力，這是他們融合過程的第一個障礙！
第二天，千手扉間當著眾木葉忍者的面宣佈千手唯繼任三代火影，而二代雷影艾也趁此宣佈退休，並將雷伊推到前臺任三代雷影。
同時在兩個村子眾忍者的見證下，三代火影千手唯以及三代雷影艾簽署融合協定，就此木葉雲隱共同體正式成立。
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這訊息一經傳出來，頓時在忍界引起軒然大波。人們一開始似乎都不怎麼看好忍村聯合體的未來。
然而，接下來的發展就有些讓他們始料未及！
半個月後，三代火影千手唯帶著忍者大軍來到火之國國都，和平解決大名殘存勢力。而三代雷影艾那邊則要血腥許多，不過最後也順利解決雷之國大名的眾多依附者。
自此，火之國與雷之國融合在一起，而千手扉間與二代雷影艾分別任兩個分割槽的政治首腦，兩個村子的軍政也因此緊緊聯絡在一起。
三個月後，千手唯利用飛雷神之術和天送之術，成功開發出第一代空間傳送結界，結界的查克拉來源則是那被封印的八尾，結界日常只需要四位上忍就能維護運轉。
半年後，雲隱木葉聯合忍校成立，忍校就建立在木葉村空間結界附近。三代火影千手唯以及三代雷影艾分別任兩個學校的名譽校長、副校長。
這半年來，雲隱和木葉忙著融合的大事兒，而霧隱村與巖隱村的戰爭剛好也打得如火如荼。
原本二代土影無以及二代水影鬼燈幻月打算乘著木葉與雲隱交戰，想要渾水摸魚，在火之國趁火打劫一番。
然而他們還未行動，就聽聞木葉與雲隱的戰爭結束了。
更讓他們瞠目結舌的是，當今的三代火影千手唯年僅十二歲，便以一己之力結束戰爭，他具有木葉村木遁與寫輪眼兩大血繼限界，實力比初代千手柱間更勝一籌。
巖隱村和霧隱村也知道突襲火之國的機會已經轉瞬即逝，最後他們不得已紛紛沿著原路返回。
二代土影無見三代火影武力壓服了雲隱村，不由得也有些動心，他也想要效仿千手唯，吞併霧隱村，這樣一來，他以後就能戰略上包圍火之國，更何況霧隱村那個小鬍子頭頭鬼燈幻月與他有宿仇，此仇不報，他實難心安。
於是，無帶著自己的弟子大野木，率領著精英忍者隊伍，利用自己強大的感知能力以及秘術無塵迷塞，悄悄跟隨著霧隱部隊的行蹤，然後出其不意地發動了突襲。
結果，在這場戰爭中，無與鬼燈幻月同歸於盡，而巖隱村與霧隱村也都元氣大傷，最後不得不簽訂和解條約。
至此，第一次忍界大戰歷經一年半的時間，草草地就結束了。
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