楊漣、劉一燝等見到朱由校即叩首山呼萬歲，並保護朱由校離開乾清宮，到文華殿接受群臣的禮拜，決定以本月六日舉行登基大典。
為了朱由校的安全，諸大臣暫將他安排在太子宮居住，由太監王安負責保護。
李選侍挾持朱由校的目的落空，又提出凡大臣章奏，先交由她過目，然後再交朱由校，朝臣們強烈反對。
朝臣們要求李選侍移出乾清宮，遷居噦鸞宮，遭李選侍拒絕。
李選侍又要求先封自己為皇太后，然後令朱由校即位，亦遭大臣們的拒絕，矛盾日漸激化。
朱由校御乾清宮登基大典日期迫近。至初五日，李選侍尚未有移宮之意，並傳聞還要繼續延期移出乾清宮。
內閣諸大臣站在乾清宮門外，迫促李選侍移出。朱由校的東宮伴讀太監王安在乾清宮內力驅，李選侍萬般無奈，懷抱所生八公主，倉促離開乾清宮，移居仁壽宮內的噦鸞宮。
九月六日，朱由校御奉天門，即皇帝位，改年號為天啟，史稱天啟帝。
至此，李選侍爭當皇太后、把持朝政的企圖終成畫餅。
李選侍雖已“移宮”，但鬥爭並未結束。
“移宮”數日，噦鸞宮失火，經奮力搶救，才將李選侍母女救出。
反對移宮的官員散發謠言說選侍投繯，其女投井，並說“皇八妹入井誰憐，未亡人雉經莫訴”，指責朱由校違背孝悌之道。
朱由校在楊漣等人的支援下批駁了這些謠傳，指出“朕令停選侍封號，以慰聖母在天之靈。厚養選侍及皇八妹，以遵皇考之意。爾諸臣可以仰體朕心矣”。
至此，“移宮”風波才算暫告結束。
本來在這出鬧劇當中魏忠賢一開始是站在西李一方的，但後來他見東林黨勢大，皇帝登基勢在必行，很機智的與客巴巴迅速改換門庭，又成了天啟皇帝朱由校登基的功臣之一。
“陛下，那楊漣到處誣陷老奴，就是怕老奴的功勞太大，擋了他們的路啊，當初是老奴死保著陛下，他們那些宮外的大臣，哪裡知道宮闈中的艱險？”魏忠賢大哭不止。
“夠了，一遇到什麼事情你就拿朕當初登基的事情說事，當初楊漣他們的功勞的確是極大的！楊漣到現在也只是個正三品官，朕還順了你的意，把楊漣左光斗等人下了大獄，你還說什麼？”朱由校不高興道。
“陛下，楊漣左光斗雖然下了大獄，但是他們的同黨不服氣，還要繼續整死老奴啊。”魏忠賢哭道。
朱由校不耐煩的皺了皺眉頭：“你說，你到底有什麼把柄讓別人抓住了？否則你怎麼會如此懼怕、”
魏忠賢聞言大驚，覺得自己做戲是不是有點做過頭了？皇帝難得如此精明，看出了什麼破綻嗎？
“老奴沒有什麼把柄，都是他們子虛烏有誣陷老奴。”魏忠賢急忙辯解道。
“魏忠賢，那朕來問你，到現在朕也不知道楊漣彈劾你什麼，他彈劾你的事情，是不是都是實情？”朱由校大聲責問道。
朱由校原先對魏忠賢的態度不是這麼急躁的，那是因為在韋寶到皇帝身邊來之前，朱由校覺得朝政上的事情，只能與魏忠賢商量，若是自己想躲清閒，想拋開紛繁冗雜，且自己沒有能力處置的政務，只能倚重於魏忠賢，但是現在情況不同了！
朱由校有了‘備胎’，有了替代魏忠賢的‘提拔’了。
雖然韋寶年紀尚輕，又是外臣，與魏忠賢不是一類人，不可能完全取代魏忠賢，但是皇帝經過韋寶解釋許多朝政上的事情，兼之覺得韋寶這個人很聰明，很有能力，所以皇帝逐漸也對秉政恢復了一些信心。
這一切都導致，在短短一段時間內，朱由校就不再像過去那樣倚重魏忠賢了。