燃燈佛師見爭鬥已平，而釋迦摩尼之勢已經盛起，知是天意大勢所趨，便與眾佛和佛徒道：“今日之爭，也是因我而起，現如今，我的佛法已經盡數傳給了釋迦摩尼，其精於佛法，又有無上法力，從今往後，我將佛師之位傳與釋迦摩尼，你等皆歸屬其門下，好生追隨，將我佛門弘揚廣大。”
眾佛徒跟隨燃燈多年，今聽佛師如此一說，皆高誦佛號，大多不捨，但謹尊燃燈佛師之命。
燃燈將身上袈裟披於釋迦摩尼身上，作為傳承的信物，讓原本跟隨他的一幹佛門弟子，見袈裟即如同見佛門至尊。
釋迦摩尼恭敬地領受，那些原本跟隨燃燈的徒眾至此名正言順地歸於雷音寺門下，釋迦摩尼也就此稱釋迦摩尼“如來”。
如來傳承了佛法上尊，在靈山專門打造寶閣，將佛師燃燈好生安頓了。
燃燈逐漸不再參與實際諸事，被今世佛祖如來尊封前世古佛。
而孔雀和大鵬皆被封護法，也重新好生安頓。
靈鷲山也去掉鷲字，更名靈山。
那大鵬自己被佔了巢窩，原本屬於自己的靈鷲山變成了如來的靈山，心中還存有不平，得了個護法虛名，沒有供奉，而大鵬又吃食甚猛，本來每日需一條龍來食用，歸瞭如來佛門，又不得明裡吃葷腥，心裡怨氣滋生，總是想尋機遠離靈山，自立而去。
如來終於位居佛門至尊，沒有忘卻菩提，欲讓菩提做架下首座，菩提卻說不能與之共稱，也不想成其門下，本身已是個自在之仙，只願獨自清淨修行。
遂在那千山之中位於，西牛賀州的靈臺方寸山，名為“斜月三星洞”，隱身在山林洞中，傳徒授法，世外逍遙。
如來見菩提無意出世，也知道無法更改，便對菩提道：“道兄既然不願留在靈山，也莫遠去，有時機，我常來請問。”
菩提點頭，送走如來，繼續徑自修心傳道。
菩提雖未謀位，但與如來的交往沒斷，二人經常往來交流道法，菩提不與那靈山眾人往來繁瑣，每次都是如來去往那菩提處，二人暢談佛道大法，他人不知。
燃燈獲尊上古佛之稱，自此清閑，靈山大都是燃燈的後輩晚生，天地能與其等同資歷的唯有三清上神，因此燃燈便經常去與那三清談經論道，逐步不理靈山諸事。
如來居尊是佛門的大事，佛門遣使者稟告了玉帝，佛門雖然自成體系，但天地各界名義皆歸天庭掌管，玉帝得知如來已掌位，現來通告，於是便找來太上老君商量看如何安排。
老君來到玉帝議事的靈霄寶殿，依禮節見了玉帝，玉帝還禮，老君不等玉帝開口，先就說道：“這次找老夫來是不是商議那已經轉世修行得道的阿彌陀之事，聽說他現在居佛門之尊，法號如來？”