簡而言之，除了核心指揮之外，還要有一套與之對應的輔助系統。
以前一般都是由各個模組部分負責這些輔助功能。不過由於【主宰】整體而言太過龐大，而且在未啟動前其它部位屬於獨立離體狀態，所以需要重新構築出外部輔助系統。
主體指揮核心將以【四級智慧核心】為載體構建，希曼想要把他設計為一個【守護者】模樣的個體。在正式啟動前，【主宰】看起來就像是一個偏向於自身防護的【守護者】，其執行系統會主要偏向於指揮，而非作戰。它將作為其它小型結構構造體的指揮中心存在。
一旦戰鬥進行到一定階段，主要任務變為攻堅，【主宰】系統會先讓其它個體進行次一級合併，成為體型更大威力也更加強悍的存在。
當戰爭強度達到一定程度，【主宰】就會命令全體小型結構進行合併作戰。此時真正的主宰才會出現。一切小型結構構造體將合為一體，無論剩餘多少結構，全部合而為一。
設計【主宰】時，希瑞和希曼兩人也有一些簡單分工。大體來說【主宰】的核心指揮系統將由希瑞來主導，希曼進行輔助；外部輔助系統則剛好相反，希曼為主導者希瑞則負責一些輔助工作。其它問題則是由兩者共同研究解決。
核心指揮系統和外部輔助系統理念設想很容易，實際進行設計時卻是困難重重。
希瑞主導的核心指揮系統會有兩種形態，離體指揮形態和附體聯合形態。【主宰】未合體前是作為比【統御者】更高一級的戰略指揮中心存在，其“智慧”程度要求無疑要更高，因為整個戰場的配合以及戰略都將由其指引。
在這一方面除了例行提高其複雜程度和效能外，希瑞還將之前因為載體效能限制一直未實際新增的初級【自我學習】功能加入其中。
【自我學習】功能可以讓【主宰】在不斷對比分析中逐漸理解各種戰略戰術，要想讓【主宰】系統真正理解並學會運用各種原本獨屬於人類的戰略戰術指揮，首先要做到讓它學會對比與選擇。
只有透過大量資訊對比後，【主宰】才能獲得足夠經驗，總結出規律，從而實現戰術應用，或者創造出新的戰術來。
希瑞還沒完成主體執行系統設計，就先向【四級智慧核心序列】中新增了【自我學習】功能。然後實驗場的很多實驗助手每天工作就變成了查閱各種歷史戰役記載內容，然後將之輸入到【四級智慧核心序列】中。
【自我學習】功能會自動調取這些資訊進行分析參考以及重演和抉擇，以實現自我完善和進化。
當然現在這一功能並不完善，就算【主宰】系統設計完成，【自我學習】功能提供的資訊依然是“僅供參考”，許多情況下【主宰】仍需要執行一些既定戰術。不過【自我學習】功能會越來越完善，總有一天它創造出獨屬於自己的東西。
除了【自我學習】功能，【主宰】其它方面都像是【統御者】的增強改進升級版。當然其效能提升的確很大，要遠遠超過【統御者】百倍千倍。
【統御者】的指揮數量和“智慧程度”都有限，每個【統御者】現在的指揮極限充其量也就是幾百臺其他低階產品。在預想中，【主宰】的指揮數量是無限的，起碼也要做到能夠指揮現今生產出的所有成品毫無問題。