盡管三個紀元經歷了風風雨雨，血海早已失去了往日的輝煌，甚至連曾經“錫蘭正統”的歷史都已忘記，被天譴教會歸類到“九災”之中，被列為“禁忌力量”，但血海生物依舊本能的想要破壞“世界之脈體系”的運轉秩序。
在“官方”與“駭客”同時消失的第二紀元，對立的“防毒軟體”與“病毒”再次展開了死戰，於是就有了“世界之渦vs血海”的漫長戰役。戰爭的結局自不必多提，沒有穩定能量源頭的血海節節敗退，世界之脈體系紮根錫蘭每一處，最初的“世界主脈”分裂而出，遍佈星球。
當“世界之脈”系統正式完工後，世界之渦不再是那種一次性的毀滅兵器，而是成為了一種可以不斷迴圈生長，漸漸蘇醒了本能的，超級禁忌根源。
如果說第一紀，是“混沌科技”創造錫蘭，“世界之渦”毀滅錫蘭的全過程。那麼第二紀的發展，就是“世界之渦”重塑錫蘭，並衍生出“世界之脈”的全過程。
當第二紀發展到最巔峰時，錫蘭星球內部遍佈世界之脈，不僅如此，星球外圍也布滿了世界之脈，並將“核晶壁”內部的一切星空都連線起來。這一時期，各大神系中的主神，不少都擁有影響天體運轉的能力，諸如太陽王、月神……
第二紀，大血海在世界之渦的壓制下節節敗退，最終連“劫界·材料傳輸網路”都被世界之渦吞噬。而“天譴教會”的雛形，就此誕生！大血海徹底走向沒落，淪為敗犬。
這裡，需要普及一下“天使”與“佛陀”的小知識。
第一紀時期，負責建設大血海的“混沌高層”們靈感猛閃，惡趣味爆發，將其中充當防毒軟體的種族，稱為“佛陀”，並安排了“輪”的特殊力量。而黑鹽重工入侵錫蘭時，也極富惡搞精神與黑色幽默，將維護滅世道具“世界之渦”正常運轉，專職破壞血海體系的兵種，稱為“天使”。
這種奇葩的叫法，一直延續了整整三個紀元，這同樣是困擾了西撒十多年的答案。兩撥蛋疼的家夥蛋疼之下的蛋疼産物。
在第二紀元中期，世界之渦從血海手中，奪取了星球範圍內任意傳輸材料，製造超級生物的“材料傳輸網路”，至此大血海支離破碎，陷入衰敗，核心被大結界封印。
而“天譴教會”的雛形也就此形成，病毒系統一舉逆襲成功，肛翻了防毒軟體，華麗變身為錫蘭的正統力量，而藉助“材料傳輸系統”滿世界亂跑的“天使們”，成為了新一代的“防毒軟體”，負責清剿一切危害世界之脈體系的禁忌力量，成為了“錫蘭君”的保護神。
成王敗寇，失去了一切榮耀的“血海”，被掛上了禁忌的名稱，封印在東洲。
第二紀元，是“世界之渦”的瘋狂擴張期，也是錫蘭諸般殘留力量的融合期，原本沖突敵對的禁忌種，在世界之脈體系壓制下，彼此磨合，和諧共處，一同逃脫“天使”們的追殺。而依託世界之脈誕生的災神們，也創造了輝煌的諸神時代。
各大主脈體系下衍生出的“神系”，與“天使”關繫有親有疏，災神雖然依託“世界之脈”而強大，但並沒有維護“世界之脈”的想法，甚至為了追求更加強大的力量，主動接觸禁忌，與如今的“各大勢力”一個德行。
第二紀時期，“混沌側”遺留的力量，與“黑鹽側”衍生出的力量，還處於敵對狀態。雙方見面通常不死不休，然而真正的“混沌”與“黑鹽”，早已離開了這個渾濁失控的宇宙。